Rcpp实现R与C++的无缝连接

本文介绍了如何使用Rcpp库来提升R语言中循环等操作的效率。通过安装Rcpp包并在R环境中编译C++代码,可以实现R与C++的无缝连接。以一个简单的C++循环程序为例,展示了在R中加载并执行C++代码的过程,强调了sourceCpp函数的使用,并指出在RStudio中可以通过快捷键方便地运行C++脚本。通过这种方式,可以显著提高R代码的运行速度。
摘要由CSDN通过智能技术生成

         R的for循环非常慢,当看见这句话时:Thanks to the abstractions provided by Rcpp, the code implementing gibbs in C++ is nearly identical to the code you’d write in R, but runs 20 times faster.采用Rcpp实现R和C++的无缝连接是非常有必要的,至少从效率上讲。下面简单的介绍下我的初步成果:

         首先在R里面安装包Rcpp:install.packages('Rcpp')

         然后编写自己的c++文件,假设在Rstudio里面编写c/c++ script 如下:一个简单的循环输出循环变量程序

#include <Rcpp.h>//必须的头文件
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
void gibbs(int N, int thin) {
  for(int i = 0; i < N; i++) {
    for(int j = 0; j < thin; j++) {
      std::cout<<i<<" "<<j<<std::endl;//可以在前面using namespace std;
    }
  }
  //return(N);//可以定义返回值和函数返回值相同然
}

//下面是R脚本程序
/*** R
#格式非得这样:/*** R  
gibbs(3,1)
*/
     脚本输出:

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