Rcpp: 连接了R与C++

本文是我看《Rcpp:R与C的无缝整合》一书的一些收获，有不准确的地方，请指出也请见谅！

一、为什么使用C++代码？

在运行速度方面，C++代码的运行运行速度比R快的多。所以想在R中调用C++函数，如何调用？桥梁就是Rcpp，Rcpp是一个R包。

二、如何在R中调用/使用C++函数，以达到提高运行速度的目标呢？

一种编译、链接和载入的方法是使用inline包中的cxxfunction函数：

首先，我们需要有两个文件，一个是后缀为.cpp的C++代码文件，一个是后缀为.R的R脚本文件。在R可以调用C++函数之前，需要对.cpp文件进行编译、链接和装载到R会话中，如何实现编译、链接和装载呢？有几种方法，其中最简便的是使用inline包，inline包中的R函数cfunction(.)和cxxfunction(.)在R会话中直接编译、链接和装载C++函数。其中cxxfunction函数中的参数plugin提供了额外的头文件和库位置，一般使用plugin="Rcpp"。好消息是，在0.3.10及以后版本的inline中，提供了一个非常方便的封装器rcpp，可以自动添加plugin="Rcpp"，所以在cxxfunction(.)函数中plugin参数可以省略。cxxfunction(.)函数中需要添加的参数有（1）signature参数：提供变量及其类型。（2）body：提供c++代码。将cxxfunction(.)函数赋值给一个R对象，这个R对象就是R中的函数，通过在R中引用这个函数，从而达到调用C++函数的目的。

也可以只有一个后缀为.R的R脚本文件，其中C++代码可以放在这个R脚本文件中，用一对单引号'c++代码'出现在cxxfunction(.)前，传递给inline包里的cxxfunction()函数中的参数body。(见书P29，代码2.4)

另一种编译、链接和载入的方法是使用Rcpp的attributes：

Rcpp最近提供了一个C++和R之间更直接的联系：attributes. Rcpp attributes内化了inline中的核心特性，并且重用了诸如plugin等供inline使用的基础结构。Rcpp attributes提供了许多新函数，其中sourceCpp用于载入一个C++函数，例如，见P35，代码2.9.除此之外，我们可以把后缀为.cpp的文件，其文件名传给sourceCpp函数，由其来编译、链接和载入相应的C++代码，并赋值给R函数。

以上这两种方法都是编译、链接和载入相应的C++代码，然后赋值给R中，没有使用.Call(.)函数。