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原创 对solid平台所测数据进行转化
solid平台测序在目前已经不常见了,但是,很不幸的是我第一次下载Reads就遇上了。所以,在网上搜集了很多资料,在此整理了一下。 首先,solid测序结果他是color space 编码,不是普通的ATCG四个碱基编码,所以在格式上就不相同。 它是四行为一条read,从@行开始到!行结束,第一行代表编号,第二行代表序列,第三行代表附加信息,第四行代表质量报告。 其次,color spa...
2018-05-17 10:06:47 1211 1
原创 深度学习手记(六)之实现稀疏自编码算法(SAE)的优化过程
简单介绍自编码算法(SAE) 首先,自编码算法是一种无监督算法,可以自动从无标注数据中学习特征,可以给出比原始数据更好的特征描述。当然,这是利用了自编码的一种属性:稀疏性,因为具有稀疏性,完成了特征的自动选择而不是采用随机的方式,这种方式明显要靠谱一些。就跟主成分分析方法(PCA)类似,自动完成了降维的过程。自编码器要求输出尽可能等于输入,从公式也可以看出来。 并且它的隐藏层必须满足一定...
2018-05-11 10:04:23 11084 4
原创 module 'pandas.core.computation' has no attribute 'expressions'解决办法
出现此等“module ‘pandas.core.computation’ has no attribute xxxx”问题,都是pandas和dask两个包的版本不相配造成的。所以,要注意dask和pandas的版本。查看自己的dask和pandas包的版本,如果,是这样的话那就得进行下面操作。 pandas 0.21 dask 0.15.3这两个包版本不匹配,要么,将pandas包...
2018-05-09 15:33:17 5531
原创 特征工程与建模分析
奥斯汀动物中心是美国最大的无杀伤动物收容所,每年为18,000多只动物提供护理和庇护,并参与一系列县,市和全州保护和照护废弃物的举措,处于危险中,并放弃了动物。作为奥斯汀市开放数据计划的一部分,奥斯汀动物中心提供其收集的数据集,其中包含进入奥斯汀动物服务系统的动物的统计数据和结果。 Austin Animal Center Shelter Outcomes(奥斯汀动物中心避难所成果)数据集可以在...
2018-05-02 17:02:47 1464
mask_rcnn_coco.h5
2020-06-02
fashion-mnist数据集
2018-03-31
通过opencv-python手动截取图像兴趣区域
2017-09-26
空空如也
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