network to gephi

用gephi软件绘制networkx 网络的图

我们在学习中经常会用到networkx来处理网络数据,有时候想把一小部分的网络绘制出来,但是networkx自身的绘图相当丑陋,我们可以用gephi软件绘制,事实上,networkx和gephi有相当简单的交互

利用networkx 构建网络

graph  = nx.Graph()
graph.add_edges_from(edge_like_data)

经过上面的操作就建立了一个简单的无向图,但是我们想可视化的时候给网络的节点加上对应标签,需要另外的操作

给网络的节点加属性

for node in graph.nodes()
	graph.add_node(node, attr = value)

其中attr 是我们随意给的属性名称, value是需要给当前节点node的属性值,这里要注意,该属性值必须是int型的,不能是string 类型的,否则后面无法保存成gephi 文件

保存成 gephi 文件

nx.write_gexf(garph, './graph.gexf')

用gephi 画图

用gephi 软件打开刚才保存下的文件,节点的partition 选择会出现我们给的属性名称,选择它就可以给不同节点属性附上不同的颜色,然后选择合适的布局算法渲染即可

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