从Gaussian 09的Hartree-Fock计算的fchk文件转换到Columbus的mocoef文件的脚本

最新推荐文章于 2022-02-18 10:16:58 发布

diradical

最新推荐文章于 2022-02-18 10:16:58 发布

阅读量1k

点赞数

分类专栏： Perl

本文链接：https://blog.csdn.net/luozhen07/article/details/35569161

版权

该脚本旨在将Gaussian 09的Hartree-Fock.fchk文件转化为Columbus软件兼容的mocoef文件。然而，由于测试阶段尚未完成，无法确保脚本的准确性。转换过程要求两软件的基组和对称性完全匹配。

摘要由CSDN通过智能技术生成

这个脚本用于将Gaussian 09的Hartree-Fock计算的.fchk文件转换到Columbus软件使用的mocoef文件。

需要说明的是，测试工作还不完善，不保证此脚本的正确性。

注意：两个软件所使用的基组以及对称性等等必须完全一致！

#! /usr/bin/perl

# code by luozhen

# ATTENTION: MAKE SURE that the SAME BASIS SET has been used in the two softwares.

# results saved in the file "mocoef"
# you MUST have the access to write in the work directory.
open (Columbus, ">mocoef") or die "Can not create file \"mocoef\"!";

# read input data
# use command as "./hfg09tocol.pl inputfile" in bash shell.
while (<>) {
	push @lines, $_;
}

# check necessary info
while ($id < @lines) {
        if ($lines[$id] =~ m/Number of electrons.*([0-9][0-9]+)/) {
                $count_electrons = $1;
        } elsif ($lines[$id] =~ m/basis functions.*([0-9][0-9]+)/) {
		$count_basis_func = $1;
	} elsif ($lines[$id] =~ m/independent function