【代码报错】OSError: Can‘t load tokenizer for ‘emilyalsentzer/Bio_ClinicalBERT‘.

在服务器,通过 transformers 库加载模型:

from transformers import AutoTokenizer, AutoModel
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained("emilyalsentzer/Bio_ClinicalBERT")
model = AutoModel.from_pretrained("emilyalsentzer/Bio_ClinicalBERT")

类似的代码,都会有如下报错(因为无法链接到hugging face网址):

我们只能在本地下载模型上传到服务器后,再进行加载。(本地也是同样的方式,只是不需要上传到服务器了)具体操作如下:

1. 搭梯子去hugging face官网:Hugging Face – The AI community building the future.

2. 输入你想要的模型,找到对应的模型。

3. 点进 Files and versions,可以看到模型权重。下载自己需要的版本,我需要的是pytorch版本。

4. 最好下载一下另外两个文件。注意下载后要放在同一文件夹下,同时不要改文件名和文件格式

5. 将代码中的模型名字改成到文件夹的路径就行(程序会自行搜索文件夹里面对应名字的权重)。

tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained("路径/Bio_ClinicalBERT")
model = AutoModel.from_pretrained("路径/Bio_ClinicalBERT")

#如果有用上configue文件:
tokenizer = BertTokenizer.from_pretrained(config['text_encoder'])

#就将configue文件下对应的名字改成路径就行。
text_encoder:'emilyalsentzer/Bio_ClinicalBERT'  --> text_encoder: '路径/Bio_ClinicalBERT'

6. 完成上述,假设出现以下错误:检查到文件夹的路径,以及从hugging face上下载的文件格式没有发生改变

  • TypeError: expected str, bytes or os.PathLike object, not NoneType
  • UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0x80 in position 0: invalid start byte

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OSError: /data1/home/zhangleyi/anaconda3/envs/idm/lib/python3.8/site-packages/torch/lib/../../../../libmkl_core.so: invalid ELF header 是一个错误提示,它通常出现在使用PyTorch时遇到的问题。这个错误表示在加载MKL(Math Kernel Library)时发生了问题,可能是由于文件损坏或不完整导致的。 MKL是一个数学库,用于加速科学计算和深度学习任务。它提供了高效的线性代数、傅里叶变换和随机数生成等功能。当你使用PyTorch进行计算时,它会依赖MKL来提供高性能的数学计算。 出现这个错误的原因可能有以下几种情况: 1. MKL库文件损坏:可能是由于下载或安装MKL时出现了问题,导致库文件损坏或不完整。 2. 环境配置问题:可能是由于环境变量或路径设置不正确,导致无法正确加载MKL库文件。 3. 兼容性问题:可能是由于PyTorch版本与MKL版本不兼容,导致加载失败。 解决这个问题的方法可以尝试以下几种: 1. 重新安装PyTorch:尝试重新安装PyTorch,确保下载和安装过程没有出错。 2. 更新MKL库:尝试更新MKL库到最新版本,可以通过官方网站下载并安装最新的MKL库。 3. 检查环境变量和路径设置:确保环境变量和路径设置正确,可以参考PyTorch的官方文档或相关教程进行配置。 4. 检查PyTorch和MKL的兼容性:确保使用的PyTorch版本与MKL版本兼容,可以查看PyTorch的官方文档或相关文档了解兼容性信息。
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