1610: DNA序列---变异问题 - 模拟

1610: DNA序列---变异问题

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题目描述

    遗传是子代保持亲代特性的现象，变异是指子代与亲代存在不同之处。所谓突变，是指DNA序列在复制的过程中出现了可遗传性的改变。突变是某些遗传性疾病的主要原因。比如。染色体重组，基因突变等。其中，基因突变是造成变异的主要原因。
     在DNA序列中，基因突变可能将一种带有遗传信息的密码子变成另外一种未知信息。我们研究的是，对给定的一条变异的DNA序列片段，有多少密码子被改变的。
    假设有n个不同的密码子A1, A2，…, An，每个密码子都是由A,G,C,T 组成的长度≤10的字符串，并且任意密码子之间相互不为前缀。
    给定一个由上述若干个密码子组成的原始DNA序列片段T（长度≤ 500），和k个等长的有变异的DNA序列S1,S2，…, Sk  你能否帮助Dr. Kong找到每条变异DNA片段中发生变异的密码子个数。

输入

输入有多组测试数据（不超过6组），每组数据格式如下：
第一行：     n  k        （ 1≤ n ≤ 100      1 ≤ k ≤ 10）
接下来有M行：   A1, 
                        ……
                        An
第M+2行：           T       
接下来有K行：  S1,
                        ......
                        Sk

输出

输出每条变异DNA序列中发生变异密码子的个数。

样例输入

5 2
GCT
ACT
AGTT
AAAAAGGGGG
CATAAGGAGA
AGTTACTACTAAAAAGGGGG
AGTTACCACTAAAAAGGGGG
GTCAACTGCTAACGAGGGGG

样例输出

1
3

思路：

暴力匹配就好，用substr处理string

string newS=oldS.substr(pos,len)

从pos处截len长的字符串赋给newS

注意：多组样例！！！

代码如下：

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<map>
#include<stack>
#define ll long long
using namespace std;
 
struct A{
    string s;
    int len;
}v[505];
string t;
string P[105];
int n,k,q=0;
 
bool judge(int from,int to){//截取[from,to]的字符串
    string tmp=t;
    tmp=tmp.substr(from,to-from+1);
    for(int i=1;i<=n;i++){
        if(tmp==P[i]){
            v[q].s=tmp;
            v[q++].len=tmp.length();
            return true;
        }
    }
    return false;
}
 
int main(){
    while(cin>>n>>k){
        for(int i=1;i<=n;i++){
            cin>>P[i];
        }
        cin>>t;
        int len=t.length(),last=0;
        for(int i=0;i<len;i++){
            if(judge(last,i)){
                last=i+1;
            }
        }
        while(k--){
            string tmp;
            cin>>tmp;
            int ans=0,sum=0;
            for(int i=0;i<q;i++){
                string s=tmp;
                s=s.substr(sum,v[i].len);
                if(s!=v[i].s){
                    ans++;
                }
                sum+=v[i].len;
            }
            cout<<ans<<endl;
        }
        memset(v,0,sizeof(v));
    }
}