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原创 超详细教程:如何在笔记本上run起大模型?没有GPU也可以!(Windows/Mac)
本文以最近刚刚发布的生物医药大模型——BioMedGPT为例,本教程提供了接触大模型技术的第一步,整理和介绍了在MacBook和Windows笔记本上如何从头开始跑起一个大模型,当然里面用到的技术也同样适用于对其他大模型进行操作。
2023-08-27 22:27:47
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week 8
本节课将带来基因表达和剪切相关内容的学习,首先介绍了基因测序以及表达的基本概念,并粗浅的介绍了深度学习可以做的事提示以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考。
2022-07-16 15:27:22
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week 7
本节讨论的是深度学习的可解释性。模型本身意味着知识,可解释性对于如深度学习这样的“黑盒模型”而言,是解释其为何做出如此判断的原因和方法的根本所在,能够帮助模型朝着人类预期的方向工作。在许多场景,如推荐、医疗等场景有很大的应用前景。...
2022-07-03 19:54:28
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week6
本节课针对深度学习在调控基因组学(Regulatory Genomics)之中的应用进行讲述。首先介绍基因调控构建的基础模块,然后介绍了传统的基因调控以及主成分分析方法。随后介绍了CNN和DNN在调控基因组学的应用。还有客座教授分享了其将深度学习用于Hi-C looping之中的工作。...
2022-06-21 22:48:02
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week5
基因通过调控,表达不同的细胞类型,从而在人体内产生不同的器官。
2022-06-12 17:30:55
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week4
Recurrent Neural Networks LSTMs, Transformers, Graph Neural NetworksRecurrent Neural Networks (RNNs)Encoding timeRNNAlternative architectures for RNNsLSTMTransformerGNNGraph neural netsApplication to “classical” network problemsUnsupervised learning with G
2022-05-29 23:30:37
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week3
Convolutional Neural NetworksKey ingredients of a CNN如何使用卷积神经网络翻译像素的概念why pooling一些卷积过程中常见的实际问题汇总paddingstrideReal-world Feature Invariance: Data augmentationdifferent architecturesLeNetThe art of CNN training需要大量数据归一化问题梯度消失/爆炸问题小批量梯度下降训练中的优化问题参数tuning训练/验
2022-05-22 22:16:31
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week2
MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week2What is Machine LearningTraditional Neural NetworksHow can we use gradients for optimization?How can we use gradients to train a deep neural network?What performance metrics should we use?Improving generaliz
2022-05-08 10:59:40
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原创 MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week1
MIT-6874-Deep Learning in the Life Sciences Week1Week1 IntroWhy deep learning in life scienceWhy computational BiologyIntro to Machine Learning==机器学习推理的基本理论:贝叶斯原理==Classification and clusteringIntro to GenomicsWhere to make in progress?Week1 IntroWhy de
2022-04-30 11:33:37
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原创 NLP with Transformers 之 Attention & Transformer
Transformer相关原理Attention1. seq2seq模型2. AttentionTransformer1. 从整体宏观来理解 Transformer2. 从细节来理解 Transformer2.1 Transformer的输入2.2 Encoder(编码器)2.3 Self-Attention 整体理解2.3 Self-Attention 的细节2.3.1 计算Query 向量,Key 向量,Value 向量2.3.2 计算 Attention Score(注意力分数)2.3.3 使用矩阵计
2021-08-18 21:33:06
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原创 Leetcode精选50题-Day17
Leetcode精选50题-Day17344 反转字符串1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/reverse-string/)2. 思路&代码557 反转字符串中的单词 III1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/reverse-words-in-a-string-iii/)2. 思路&代码344 反转字符串1. 题目描述2. 思路&代码双指针法class Solution
2021-01-29 20:28:44
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原创 Leetcode精选50题-Day15
Leetcode精选50题-Day15231 2的幂 数组中的第K个最大元素1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/power-of-two/)2. 思路&代码235 二叉搜索树的最近公共祖先1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/lowest-common-ancestor-of-a-binary-search-tree/)2. 思路&代码236 二叉树的最近公共祖先1. [题目描述](https:
2021-01-27 20:40:55
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原创 Leetcode精选50题-Day14
Leetcode精选50题-Day14215 数组中的第K个最大元素1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/kth-largest-element-in-an-array/)2. 思路&代码217 存在重复元素1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/contains-duplicate/)2. 思路&代码230 二叉搜索树中第K小的元素1. [题目描述](https://leetcode-cn.com
2021-01-26 19:19:57
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原创 Leetcode精选50题-Day13
Leetcode精选50题-Day13160 相交链表1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/intersection-of-two-linked-lists/)2. 思路&代码169 多数元素1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/majority-element/)2. 思路&代码206 反转链表1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/reverse-
2021-01-24 15:52:25
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原创 Leetcode精选50题-Day12
Leetcode精选50题-Day11146 LRU缓存机制1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/lru-cache/)2. 思路&代码148 排序链表1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/sort-list/)2. 思路&代码155 最小栈1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/min-stack/)2. 思路&代码146 LRU缓存机制
2021-01-23 21:00:51
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原创 Leetcode精选50题-Day11
Leetcode精选50题-Day11136 只出现一次的数字1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/single-number/)2. 思路&代码141 环形链表1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/linked-list-cycle/)2. 思路&代码142 环形链表 II1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/linked-list-cycle-i
2021-01-22 21:54:17
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原创 Leetcode精选50题-Day10
Leetcode精选50题-Day10121 买卖股票的最佳时机1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/best-time-to-buy-and-sell-stock/)2. 思路&代码122 买卖股票的最佳时机 II1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/unique-paths/)2. 思路&代码124 二叉树中的最大路径和1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/pro
2021-01-21 20:43:45
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原创 Leetcode精选50题-Day09
Leetcode精选50题-Day09088 合并两个有序数组1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/unique-paths/)2. 思路&代码089 格雷编码1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/unique-paths/)2. 思路&代码104 二叉树的最大深度1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/unique-paths/)2. 思路&
2021-01-20 20:30:50
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原创 Leetcode精选50题-Day08
Leetcode精选50题-Day08043. 字符串相乘1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/unique-paths/)2. 思路&代码2.1 动态规划2.2 组合数学043. 字符串相乘1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/climbing-stairs/)2. 思路&代码2.1 直接递归解法2.2 直接DP,空间复杂度O(n)2.3 还是DP,空间复杂度O(1)2.4 斐波那契数列的计算公
2021-01-19 21:47:29
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原创 Leetcode精选50题-Day07
Leetcode精选50题-Day07043. 字符串相乘1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/spiral-matrix/)2. 思路&代码043. 字符串相乘1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/rotate-list/)2. 思路&代码043. 字符串相乘1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/spiral-matrix-ii/)2. 思路&am
2021-01-18 21:47:24
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原创 Leetcode精选50题-Day06
Leetcode精选50题-Day06043. 字符串相乘1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/multiply-strings/)2. 思路&代码3. 复杂度分析1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/permutations/)2. 思路&代码3. 复杂度分析1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/merge-k-sorted-lists/)2. 思
2021-01-17 21:09:30
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原创 Leetcode精选50题-Day05
Leetcode精选50题-Day05023 合并K个升序链表1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/merge-k-sorted-lists/)2. 思路&代码3. 复杂度分析026 删除排序数组中的重复项1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/remove-duplicates-from-sorted-array/)2. 思路&代码3. 复杂度分析033 搜索旋转排序数组1. [题目描述](htt
2021-01-16 21:54:06
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原创 Leetcode精选50题-Day04
Leetcode精选50题-Day04016 最接近的三数之和1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/container-with-most-water/)2. 思路&代码3. 复杂度分析020 有效的括号1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/valid-parentheses/)2. 思路&代码3. 复杂度分析021 合并两个有序链表1. [题目描述](https://leetcode-cn.co
2021-01-15 21:38:40
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原创 Leetcode精选50题-Day03
Leetcode精选50题-Day03011 盛最多水的容器1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/container-with-most-water/)2. 思路&代码2.1 我的解法3. 复杂度分析014 最长公共前缀1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/longest-common-prefix/)2. 思路&代码2.1 直接解法2.2 奇技淫巧3. 复杂度分析015 三数之和1.
2021-01-13 22:01:38
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原创 Leetcode精选50题-Day02
Leetcode精选50题-Day02007 整数反转1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/reverse-integer/)2. 思路&代码2.1 我的直接解法:2.2 巧妙解法(利用位运算)3. 复杂度分析008 字符串转换整数 (atoi)1. [题目描述](https://leetcode-cn.com/problems/string-to-integer-atoi/)2. 思路&代码2.1 普通遍历版本2.2 有限状态机2.
2021-01-12 23:07:04
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原创 Leetcode精选50题-Day01
Leetcode精选50题-Day01002 两数相加思路&代码复杂度分析004 寻找两个正序数组的中位数思路&代码复杂度分析005 最长回文子串思路&代码复杂度分析好菜,无从下手第一场下来感觉学到的还挺多的,编程不仅仅是对编程语言的使用,也包含了数据结构的设计巧妙地减少复杂度,还有智力的比拼。。比如一些很妙的解法。总而言之就是多做,多练,多见识002 两数相加题目地址:两数相加思路&代码参考几位大佬的解题思路:官方题解;画手大鹏由于输入的两个链表都是逆序存
2021-01-11 22:52:16
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原创 Task04——网络训练与测试
Task04——网络训练与测试1. 模型训练2. 后处理2.1 目标框信息解码2.2 NMS非极大值抑制2.3 代码实现3. 单图预测推理4. VOC测试集评测4.1 mAP指标5. 小结写在前面:最近有一丢忙,拖到ddl才开始写。昨天参加了一个面试,面试官问了很多数字图像处理的基础知识,都是曾经看过的但是回答的并不好,有点沮丧。直接反映了自己基础知识不扎实的问题。这一部分是动手学CV-Pytorch第三章3.6节的内容看了一下群里的优秀博客,真心推荐一下这个同学的前三个TASK的博客,写的炒鸡好
2020-12-27 21:18:26
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原创 Task 3-损失函数设计
Task 3-损失函数设计0. 学习内容及任务描述1. Matching Strategy2. Loss Function3. Hard Negative Mining3.1 具体过程3.1.1 正样本获得3.1.2 负样本获得3.1.3 难分样本挖掘3.1.4 Hard example mining3.1.5 SSD 的 negative mining 的过程为:4. 小结写在前面~感谢Datawhale的小伙伴用心编写提供了这么好的教程:动手学CV-Pytorch,把之前很难懂的一些问题讲得很明了~
2020-12-21 17:14:34
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原创 Task2-网络设计
Task2-网络设计0.学习内容及任务描述1. 锚框1.1 关于锚框1.1.1 设置不同尺度的锚框1.1.2 锚框与特征图的对应1.1.3 锚框类别信息的确定1.2 锚框之如何生成2. 结构模型2.1 以VGG16作为backbone2.2 分类头和回归头2.2.1 边界框编码&解码2.2.2 分类头与回归头预测写在前面感谢datawhale的小伙伴用心编写提供了这么好的教程:动手学CV-Pytorch再推荐一下这篇文章: 目标检测中的Anchor机制回顾,前面的历史溯源参考了这篇文章的开头
2020-12-18 17:07:00
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原创 TASK1-目标检测基本概念及数据集VOC
DAY1-目标检测基本概念及数据集VOC0.学习内容及任务描述1. 目标检测基本概念1.1 目标检测和图像分类的区别1.2 目标检测思路1.3 目标框定义方式1.4 交并比(IoU)2. 目标检测数据集VOC2.1 VOC数据集简介2.2 VOC数据集的dataloader的构建2.2.1 数据集准备2.2.2 构建dataloader0.学习内容及任务描述在task1中,需要学习两块内容:目标检测基本概念 和 目标检测经典的VOC数据集分别对应《动手学CV-Pytorch》的3.1和3.2两节:
2020-12-15 10:55:52
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原创 windows 10 在Anaconda下配置tensorflow环境总结
目录在前面倒点儿苦水感谢各位博主Anaconda 安装TensorFlow 环境搭建新建环境Tensorflow 安装附录常用conda命令在前面倒点儿苦水配置环境简直是科研路上的一道坎,每次配置环境总是出现一堆意想不到的问题,旧的问题干掉了,千千万万个新问题站起来。能做的就是不断地记录总结,方便日后查阅。感谢无数铁子写的帖子,帮我艰难的越过了一道又一到的坎。感谢各位博主这位博主写的特别好,特别详细清晰,她的博客里还有其他的内容也很值得学习。 https://www.cnblogs.com/max
2020-11-29 13:43:28
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原创 关于MathType 7与 Word 2016不兼容问题的解决方式
今天给Word安装MathType7,结果无法使用,点开MathType直接闪退在网上找到了解决方法,在此记录一下:所有步骤流程都是按照下面这位用心的博主提供的方法进行的:https://blog.csdn.net/qq_39516859/article/details/103512382只是有一点不同,虽然我的电脑是64位的,但是我从64的文件夹里拷出两个文件到Word的信任文件夹中并不好用,提示无法打开MathPage.wll,点开MathType依然闪退,后经遇到同样问题的盆友提示,尝试从32
2020-10-18 15:08:27
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原创 python读取mat数据文件
这里写自定义目录标题欢迎使用Markdown编辑器新的改变功能快捷键合理的创建标题,有助于目录的生成如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中、居左、居右SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式新的甘特图功能,丰富你的文章UML 图表FLowchart流程图导出与导入导出导入欢迎使用Markdown编辑器你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Mar
2020-10-06 17:34:24
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原创 在Anaconda下安装Pytorch
在Anaconda下安装Pytorch之前在Anaconda中新建了个环境安装tensorflow,但是后来忘了怎么装的了。。现在装Pytroch,又重新来了一次,主要参考这个:https://blog.csdn.net/qq_33183517/article/details/90484840讲得特别明白但是过程中中间出了很多小问题,参考了https://blog.csdn.net/qq_...
2019-11-09 23:16:01
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原创 python从文件夹中取一定数量图片
前面转自:https://www.jianshu.com/p/2777a74c7985按比例从文件夹中取一定数量图片# -*- coding: utf-8 -*-import os, random, shutildef moveFile(fileDir): pathDir = os.listdir(fileDir) # 取图片的原始路径 filenumber = le...
2019-10-31 09:38:45
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原创 python中统计列表中各个元素个数/次数的模块
参考:https://jingyan.baidu.com/article/47a29f24ef75ce80142399dc.html并感谢https://blog.csdn.net/qq_17753903/article/details/85345996博主对于可哈希的简单易懂的解释~~正文开始:需要用到collections模块的Counter类。神器!import collection...
2019-10-25 21:00:20
3616
转载 【深度学习】分类指标accuracy,recall,precision等的区别
本文转自:https://blog.csdn.net/zzc15806/article/details/83413333#commentBox这几个概念总是搞不清楚,查到了一篇讲的很明白的博客,记录下来~感谢博主~~在机器学习里面做一些分类任务时,经常会使用到一些评价指标,下面就一些常用的指标进行详细的说明。上图表示为一个二分类的混淆矩阵(多分类同理,只需要把不属于当前类的其他类都考虑为...
2019-09-05 21:47:30
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原创 cx-Freeze安装
笨人python3.6 windows10系统安装(离线)官网https://pypi.python.org/pypi/cx_Freeze下载相应的whl,在下载目录执行pip install d:\xxx\cx_Freeze-5.1.1-cp36-cp36m-win64.whl(这个版本由自己电脑和安装的Python版本决定,前面路径由whl文件所在位置决定)(在线)cmd 输入 pi...
2019-08-24 18:26:01
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转载 python 为字符串补零
转载:http://www.sharejs.com/codes/python/8037python中有一个zfill方法用来给字符串前面补0,非常有用n = "123"s = n.zfill(5)assert s == "00123"zfill()也可以给负数补0n = "-123"s = n.zfill(5)assert s == "-0123"对于纯数字,我们也可以通过格...
2019-08-21 09:44:10
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原创 鹅妹子的skimage.measure.regionprops
参考:https://scikit-image.org/docs/dev/api/skimage.measure.html#skimage.measure.regionpropsskimage的强大无需多言,但是木有想到厉害成这个亚子!简直是宝藏函数!今天简单记录skimage.measure使用中遇到的惊喜。一、汇总函数功能skimage.measure.find_c...
2019-07-04 19:55:20
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空空如也
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