配准
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云若祯初
工作方向总在变化的程序员。
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【配准】2020年“基于深度学习的医学影像配准”期刊论文速览(PR,TMI,MIA)
针对基于深度学习的医学影像配准,检索了最新的(2020年)期刊论文,包含PR、TMI、MIA3个期刊,下面是浏览论文中的一些记录。其中有两篇论文提供了代码。一、PRDeep morphological simplification network (MS-Net) for guided registration of brain magnetic resonance images(沈定刚) 解决的问题:Deformable brain MR image registration...原创 2021-01-11 21:59:42 · 3709 阅读 · 1 评论 -
【配准】gdbicp配准工具包的安装与使用
这个工具包实现了Generalized Dual Bootstrap-ICP 配准算法,可用来做二维图像的全自动配准。软件的简介可见Generalized Dual Bootstrap-ICP Software Guide Introduction安装与使用这个软件的安装对用户很不友好,点击下载按钮出现的竟然是一个网页,网页里的代码还是用perl写的。在这之前我连perl是什么都不知道……折腾良久,最终在win10上装上了。在这个网址上下载gdbicp.zip这个压缩包,然后解压即.原创 2020-06-17 15:23:35 · 623 阅读 · 8 评论 -
【配准】python代码:标注关键点(keypoint)并生成位置坐标的文本文件
配准常见的评判标准就是关键点坐标之间的误差(TRE),关键点的标注就成了绕不开的过程。有很多图像处理软件都可以实现在图像上画点并且显示鼠标处的坐标,如windows自带的绘图软件,ImageJ等,但是我当下的任务需求是标记图像对上对应的关键点,并生成相应的txt文本。稍微调查了一下各种标记软件,未果,最终决定自己写代码实现。关键函数1、matplotlib.pyplot.ginput()这个函数可以用来捕获鼠标点击处的坐标,函数返回一个列表,保存着每次点击的坐标。具体的函数说明看下...原创 2020-05-24 22:19:12 · 4122 阅读 · 3 评论 -
【配准】弱监督(Weakly-Supervised)系列配准论文阅读
弱监督系列论文汇总表 序号 发表情况 要点 1 ISBI2018 弱监督配准框架 2 MIA2018 多尺度Dice,新的网络,大量的实验 3 TMI2018 ...原创 2019-11-01 21:51:16 · 4003 阅读 · 2 评论 -
【配准】空间变换网络Spatial Transformer Networks原理分析
说明:此文只分析STN层的原理。STN由三个部分组成:1、定位网络生成空间变换参数,如二维仿射变换参数:a11,a12,a21,a22,t1,t2。可以是任意的回归网络,如卷积网络,全连接网络等2、栅格生成器 由变换参数获取在输入特征图上面的采样位置。下面详细解释。设U的shape为(H,W,C),对应于高、宽、通道数,我们想要变换之后的特征图为V,V的...原创 2019-08-28 17:12:30 · 2213 阅读 · 0 评论 -
【配准】2019医学图像配准中的深度学习综述论文解读(2)
承接上文。本文是双监督、弱监督、自监督部分的总结和个人感想,见解较为粗浅, 还请同行多多指教。论文原文:Deep Learning in Medical Image Registration: A Survey————————————————————————————————————————————————————————四、弱监督或双监督的形变场估计双监督:既选用扭曲后图像与参...原创 2019-07-30 13:22:50 · 3712 阅读 · 3 评论 -
【配准】2019医学图像配准中的深度学习综述论文解读(1)
这篇博文我转载到了知乎专栏上并进行了参考文献的扩充,可供参阅。 https://zhuanlan.zhihu.com/p/92032320论文:Deep Learning in Medical Image Registration: A Survey阅读中主要关注点:配准的各个流派大致的思路,比较有意思的想法,刚性配准的网络架构与目标函数一、研究情况梗概目前采用...原创 2019-07-01 11:19:53 · 7670 阅读 · 5 评论