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原创 R包画图出现PDF损坏

比如下面,直接生成的pdf,代码没问题就是打不开。改成ggsave试试,需要先安装ggplot2包。有时候代码很正确,但是图就是画不出来。

2024-02-28 10:49:15 635

原创 安装R包出现<stdin>:1:10: fatal error: ft2build.h: 没有那个文件或目录

stdin>:1:10: fatal error: ft2build.h: 没有那个文件或目录。centos运行下面命令,其他系统可能要更改包名。原因是系统缺少一些包。

2024-02-28 10:37:31 628

原创 更新GCC版本

用source /opt/rh/devtoolset-9/enable。之前版本是4,安装很多东西失败,提升到9好了很多。gcc --version 查看改成了9版本。2.临时更改,只在当前会话生效。如果gcc -v 还是老版本。运行以下命令:一个一个运行。

2024-02-28 10:24:44 621

原创 生信R包安装出现C++17 standard requested but CXX17 is not defined

在里面写上CXX17 = g++ -std=c++17 -fPIC,保存。这个问题首先提升gcc版本到9,可以看本人另外一篇文档。然后在~目录下,也就是/root 创建.R文件夹。在文件夹中创建文件,名称写Makevars。

2024-02-28 10:17:59 655

原创 Blast比对出现错误BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database

Blast比对出现错误BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database

2023-03-14 14:18:39 2243 2

原创 Linux上部署和使用Blast序列比对工具

第一步:Index of /blast/executables/blast+/LATESThttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/去这个网址,下载ncbi-blast-2.13.0+-x64-linux.tar.gz,也就是Linux版本第二步:在linux上创建好文件夹,比如我在/home下创建soft文件夹,用于安装Blast软件.第三步:把下载好的压缩包,放到文件夹下,进行解压,命令如:tar -zxvf ncbi-bl

2022-12-07 14:35:55 3792 2

空空如也

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