rdkit获得原子的标准排序序号
发现rdkit同一个分子不同操作得来的mol都原子排序是不同的
解决:以inchi为标准
参考
rdkit.Chem.inchi.MolToInchiAndAuxInfo(mol, options=’’, logLevel=None, treatWarningAsError=False) — rdkit文档
auxInfo详细解释在inchi文档
for i,atom in enumerate(mol_H_Rc.GetAtoms()):
atom.SetAtomMapNum(i)
mol_
原创
2022-03-12 17:05:23 ·
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