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原创 MetaPhlaAn 所有样本不同层级物种统计
可参先考以下方法将一个样本的 Metaphlan结果,分为不同的level往往我们会统计所有样本里不同level的物种数量,可参考以下代码。
2023-12-12 10:14:22
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原创 MetaPhlAn 结果文件处理获得各层级物种丰度
MetaPhlAn 对宏基因组样本做物种丰度注释会获得 profiled_metagenome.txt 文件,里面储存了各层级物种丰度结果。以下代码对该结果文件处理,分别获得各层级物种丰度的文件。
2023-12-10 23:11:26
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原创 window 下Jupyter Notebook支持pytorch(anaconda 安装)
window 下Jupyter Notebook支持pytorch(anaconda 安装)
2022-07-11 23:25:55
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原创 Interproscan linux版本详细安装教程及运行报错解决方案
解决问题:interproscan 软件 在Linux中配置(个人经验,仅供参考~)文章目录前言一、参考文档二、需要软件Software requirements:1.下载压缩包2.解压3. 和hmm model 建立索引4. pather model5. 运行三、问题解决1 软件缺失总结前言提示:这里可以添加本文要记录的大概内容:例如:随着人工智能的不断发展,机器学习这门技术也越来越重要,很多人都开启了学习机器学习,本文就介绍了机器学习的基础内容。提示:安装的版本是一、参考文档htt.
2022-04-09 20:08:39
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空空如也
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