m0_55059521的博客

可参先考以下方法将一个样本的 Metaphlan结果，分为不同的level往往我们会统计所有样本里不同level的物种数量，可参考以下代码。

MetaPhlAn 对宏基因组样本做物种丰度注释会获得 profiled_metagenome.txt 文件，里面储存了各层级物种丰度结果。以下代码对该结果文件处理，分别获得各层级物种丰度的文件。

统计经过如megahit等软件拼接的contig长度，来评估拼接的结果。

测序数据质量检测（Q30、Q20、GC%）

eggnog 本地化及报错解决

window 下Jupyter Notebook支持pytorch（anaconda 安装）

从NCBI上快速下载目标物种基因组序列、获取SRA数据信息

解决问题：interproscan 软件 在Linux中配置（个人经验，仅供参考~）文章目录前言一、参考文档二、需要软件Software requirements:1.下载压缩包2.解压3. 和hmm model 建立索引4. pather model5. 运行三、问题解决1 软件缺失总结前言提示：这里可以添加本文要记录的大概内容：例如：随着人工智能的不断发展，机器学习这门技术也越来越重要，很多人都开启了学习机器学习，本文就介绍了机器学习的基础内容。提示：安装的版本是一、参考文档htt.