day01—跑通脑PET图像分析和疾病预测挑战赛的baseline代码

1.在ai studio上跑通模型

在其官网公开的模型中找到基于logistic回归的脑PET图像分析和疾病预测,再按照该模型的代码要求逐步运行代码即可跑通。

2.对该baseline模型的分析

本项目的数据集为脑PET图像检测数据库,其包括两类:健康和轻度认知障碍,本次竞赛的目标是找到一个模型使得对这两类的辨别尽可能准确。

2.1数据预处理

读取该数据集,并随机打乱该数据集的顺序,从而使得被训练的数据尽可能呈现正态分布,希望能够尽可能避免训练不充分的情况。

2.2特征提取

本次特征提取选择了10个维度,都是一些数理上的统计特征,比如:非零像素的数量、零像素的数量、平均值、标准差、在列方向上平均值不为零的数量、在行方向上平均值不为零的数量、列方向上的最大平均值、行方向上的最大平均值。

暂时觉得这10个特征选取得不够科学,特征提取应该在理论知识的基础上进行,我们需要在医学上了解从脑pet图像的哪些方面能够区别健康和轻度认知障碍,医生一般是如何判断的。通过阅读相关文献资料,了解针对认知障碍在临床医学上有哪些判断准则。

在了解了相关的判断准则后,再基于判断准则,利用相关数学方法设计对应的特征提取算法。那么,接下来的问题是选取哪种判断准则进行算法设计。首先,查找知网、维普等网站,我们可以得到不同准则的分类效果;其次,在百度、谷歌等网站上搜索脑pet图像的相关准则,进一步帮助选择更好的准则;最后,确定某个准则进行算法设计。

2.3模型训练

基于之前提取的特征,重复进行30次的特征提取,以增加训练样本的多样性;之后,利用逻辑回归模型训练数据,最终得到相应的训练模型。当然,也可以选用其他模型,例如:随机森林、支持向量机、卷积神经网络。

2.4预测与结果提交

利用训练好的逻辑回归模型对测试集进行预测,并将预测结果进行投票,选出最多的类别作为该样本的最终预测类别。最后,我们将预测结果存储在CSV文件中并提交结果。

目前来说,结果分数为0.47917,后续改变特征提取算法和训练模型后再进行打分。
在这里插入图片描述
现在改用CNN模型后,分数提升到0.57426,后续还需改进数据预处理、网络结构等等。
在这里插入图片描述

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