深度学习Week5-心脏病预测(RNN)

🍨 本文为[🔗365天深度学习训练营]中的学习记录博客
🍦 参考文章:[🔗深度学习100例-循环神经网络(RNN)心脏病预测]
🍖 原作者:[K同学啊|接辅导、项目定制]

  • 难度:新手入门⭐

🍺要求:

  1. 本地读取并加载数据。(✔)
  2. 了解循环神经网络(RNN)的构建过程(✔)
  3. 测试集accuracy到达87%(✔)

🍻拔高:

  1. 测试集accuracy到达89%(X)

环境:

  • 语言环境:Python3.8
  • 编译器:pycharm社区版

总体流程

一、前期准备

1.设置GPU

import tensorflow as tf

gpus = tf.config.list_physical_devices("GPU")

if gpus:
    gpu0 = gpus[0]  # 如果有多个GPU,仅使用第0个GPU
    tf.config.experimental.set_memory_growth(gpu0, True)  # 设置GPU显存用量按需使用
    tf.config.set_visible_devices([gpu0], "GPU")

print(gpus)

这里遇到了bug,一是h5py版本出错了,卸了重装就行,二是缺少CUDNN64_8.DLL文件,这里推荐一个下载dll文件的网址,不收费可中文,非常好用。

cudnn64_8.dll 搜索结果 | DLL‑files.com

[PhysicalDevice(name='/physical_device:GPU:0', device_type='GPU')]

2. 导入数据

数据是csv表格,里面有各种参数,我们通过对数据的处理训练,实现预测功能

数据介绍:

age:1) 年龄

sex:2) 性别

cp:3) 胸痛类型 (4 values)

trestbps:4) 静息血压

chol:5) 血清胆甾醇 (mg/dl

fbs:6) 空腹血糖 > 120 mg/dl

restecg:7) 静息心电图结果 (值 0,1 ,2)

thalach:8) 达到的最大心率

exang:9) 运动诱发的心绞痛

oldpeak:10)  相对于静止状态,运动引起的ST段压低

slope:11) 运动峰值 ST 段的斜率

ca:12) 荧光透视着色的主要血管数量 (0-3)

thal:13) 0 = 正常;1 = 固定缺陷;2 = 可逆转的缺陷

target:14) 0 = 心脏病发作的几率较小 1 = 心脏病发作的几率更大

把数据文件放在和代码.py同一个目录下。

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.read_csv("heart.csv")
print(df)

 3.(次要)检查数据

由于数据可能有误输入为0的,可以检查一下有没有空值,大多情况下可以跳过这一步

print(df.isnull().sum())

age         0
sex         0
cp          0
trestbps    0
chol        0
fbs         0
restecg     0
thalach     0
exang       0
oldpeak     0
slope       0
ca          0
thal        0
target      0
dtype: int64

每组数据空值个数都是0,数据正常。

二、数据预处理

1. 划分训练集与测试集

from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.model_selection import train_test_split

X = df.iloc[:,:-1] #iloc函数:对数据进行位置索引,从而在数据表中提取出相应的数据。
y = df.iloc[:,-1]

X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size = 0.1, random_state = 1)

print(X_train.shape, y_train.shape)

(272, 13) (272,)

2. 标准化

# 将每一列特征标准化为标准正太分布,注意,标准化是针对每一列而言的
sc      = StandardScaler()
X_train = sc.fit_transform(X_train)
X_test  = sc.transform(X_test)

X_train = X_train.reshape(X_train.shape[0], X_train.shape[1], 1)
X_test  = X_test.reshape(X_test.shape[0], X_test.shape[1], 1)

三、构建RNN模型

函数原型

tf.keras.layers.SimpleRNN(units,activation='tanh',use_bias=True,kernel_initializer='glorot_uniform',
recurrent_initializer='orthogonal',bias_initializer='zeros',kernel_regularizer=None,recurrent_regularizer=None,bias_regularizer=None,activity_regularizer=None,kernel_constraint=None,recurrent_constraint=None,
bias_constraint=None,dropout=0.0,recurrent_dropout=0.0,return_sequences=False,return_state=False,
go_backwards=False,stateful=False,unroll=False,**kwargs)

关键参数说明:

units: 正整数,输出空间的维度。

activation: 要使用的激活函数。 默认:双曲正切(tanh)。 如果传入 None,则不使用激活函数 (即 线性激活:a(x) = x)。

use_bias: 布尔值,该层是否使用偏置向量。

kernel_initializer: kernel 权值矩阵的初始化器, 用于输入的线性转换 (详见 initializers)。

recurrent_initializer: recurrent_kernel 权值矩阵 的初始化器,用于循环层状态的线性转换 (详见 initializers)。

bias_initializer:偏置向量的初始化器 (详见initializers).

dropout: 在 0 和 1 之间的浮点数。 单元的丢弃比例,用于输入的线性转换。

import tensorflow
from tensorflow.keras.models import Sequential
from tensorflow.keras.layers import Dense,LSTM,SimpleRNN

model = Sequential()
model.add(SimpleRNN(200, input_shape= (13,1), activation='relu'))
model.add(Dense(100, activation='relu'))
model.add(Dense(1, activation='sigmoid'))
model.summary()

 四、编译模型

设置学习率啥的 和CNN一样(吧)

opt = tf.keras.optimizers.Adam(learning_rate=1e-4)

model.compile(loss='binary_crossentropy',
              optimizer=opt,
              metrics="accuracy")

 五、训练模型

因为都是数据,训练比图片数据快不少,100轮起步

epochs = 100

history = model.fit(X_train, y_train, 
                    epochs=epochs, 
                    batch_size=128, 
                    validation_data=(X_test, y_test),
                    verbose=1)


六、模型评估

import matplotlib.pyplot as plt

acc = history.history['accuracy']
val_acc = history.history['val_accuracy']

loss = history.history['loss']
val_loss = history.history['val_loss']

epochs_range = range(epochs)

plt.figure(figsize=(14, 4))
plt.subplot(1, 2, 1)

plt.plot(epochs_range, acc, label='Training Accuracy')
plt.plot(epochs_range, val_acc, label='Validation Accuracy')
plt.legend(loc='lower right')
plt.title('Training and Validation Accuracy')

plt.subplot(1, 2, 2)
plt.plot(epochs_range, loss, label='Training Loss')
plt.plot(epochs_range, val_loss, label='Validation Loss')
plt.legend(loc='upper right')
plt.title('Training and Validation Loss')
plt.show()

 R1周的这个数据量有点少,这个抖动是正常的,可以通过扩充数据集来解决。

最后输出一下准确率(其实看第一百轮准确率即可):

scores = model.evaluate(X_test, y_test, verbose=0)
print("%s: %.2f%%" % (model.metrics_names[1], scores[1]*100))

accuracy: 90.32%

这准确率太不稳定了,我训练了两次,一次84%,这次90%...

*拔高

结合week4猴痘识别的经验,先把训练的history中的batch_size降低到32

效果相当的不好,改回去准备从学习率入手

然而学习率无论是调大还是调小,准确率都稳定在87%左右,甚至调的幅度太大准确率会有明显下降...

可能是数据集太小的缘故,以后发现优化方法再和大家分享

  • 5
    点赞
  • 38
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 1
    评论
你好!对于心脏病预测的问题,使用循环神经网络(RNN)是一种常见的方法。RNN适用于处理序列数据,而心电图信号就是一种序列数据。在使用RNN进行心脏病预测时,你可以将心电图信号作为输入序列,然后通过训练RNN模型来预测患者是否患有心脏病。 首先,你需要准备一个合适的数据集,其中包含心电图信号和相应的心脏病标签。可以使用公开的心电图数据集,如PTB数据库或MIT-BIH数据库。然后,你可以对数据进行预处理和特征工程,如数据清洗、滤波、降采样等。 接下来,你可以构建一个RNN模型。RNN模型由一系列循环层组成,每个循环层都会处理一个时间步的输入数据。你可以选择不同类型的RNN单元,如简单循环单元(SimpleRNN)、长短期记忆网络(LSTM)或门控循环单元(GRU)。通过添加适当的全连接层和激活函数,你可以将RNN模型输出映射到二分类问题(有或无心脏病)的结果。 然后,你可以使用训练集对RNN模型进行训练,并使用验证集进行模型调优。在训练过程中,你可以使用适当的损失函数(如交叉熵)和优化算法(如随机梯度下降)来最小化模型的预测误差。 最后,你可以使用测试集对训练好的模型进行评估,并计算模型的性能指标,如准确率、精确率、召回率等。这些指标可以帮助你评估模型的预测能力和泛化能力。 需要注意的是,心脏病预测是一个复杂的医学问题,仅仅使用心电图信号可能不能得到准确的预测结果。通常情况下,还需要结合其他患者的临床信息和医学知识来进行综合评估。因此,在进行心脏病预测时,建议与专业医生合作,并遵循相关的医学准则和规范。

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

牛大了2023

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值