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RSS订阅原创 Pymol图片输出不清晰的问题以及解决办法
第一种情况是用的教育版免费的Pymol，这个版本不提供高质量输出文件，并且带有水印，解决办法就是换开源版的软件或者直接购买。 第二种，在开源版使用中，首先可以在命令窗口输入“helppng”看一下输出命令的详细介绍：help pngpng命令有五个属性：文件名、宽、高、dpi（像素密度）、ray（阴影渲染），其中文件名为必选，其他可选。在用像素为单位时，dpi并不起作用，只有在in、cm为单位时才有效。...
2021-11-22 16:58:27
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原创 Modeller建模（二）-多模版、loop优化、配体
此篇对应官网教程第二个实例：advanced-example.zip，共三个大部分：多模版建模、loop优化、基于配体的优化。搜模版、选模版步骤与单模板建模相似，这里不再赘述——2mdh、1bdm、1b8p最合适。多模板建模的好处是有多个同源蛋白序列，在同源性的基础上，通过对比多样性的序列结构可以发现相对更保守的区域，在模版对齐这一步有较大贡献。1. 多模版建模1.1 模版间的对齐（salign.py）没啥可以说的，如果做别的项目，换掉输入...
2021-11-12 13:06:36
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原创 Modeller-单模板建模（basic-example实例）
本文对应第一个实例：basic_example.zip，分为七部分。七个部分即运行七个脚本，需要安装python后，在cmd命令行下运行。所有文件应该放在同一个文件夹中。我的在d盘demo文件夹中。运行“cmd”（或者打开modeller程序）输入“d：”回车输入“cd demo”回车（你得告诉程序脚本要处理的文件在哪儿放着，把运行目录设置好了）一、搜模版（build_profile.py脚本）蓝框里的文件名都可以改成自己的，当然，不改肯定不会出错。...
2021-09-25 16:17:11
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空空如也
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