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原创 叶绿体基因组PGA注释

其实关于PGA软件在windows、linux和Mac里的下载、安装、配置和测试曲老师已经写得很清楚了,作为一个小白也是按照步骤一步步来就成功了,本篇主要是自己用于记录和之后方便查找之用,里面的链接大家参考https://www.jianshu.com/p/6ac8a9fad9c9 ————>曲老师自己写的中文使用介绍https://github.com/quxiaojian/PGA ————>软件GitHub网址https://www.jianshu.com/p/126...

2022-03-16 20:47:25 1342

原创 Getorganelle的安装配置与使用

Getorganelle是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具,可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。本文主要用于对本人在学习使用Getorganelle过程中的一些步骤记录,同时也方便自己下次使用时能更快的熟悉流程。另外,本文所列举的操作步骤只是我个人在使用过程中的操作,本文的内容也是根据自身情况做了一个学习链接中内容的整合,如果大家有需要可以直接看郁文斌老师的微信公众号链接,链接我会放于文末。【小白安装方法】1.Miniconda的下载和安装Minic...

2022-02-07 23:06:36 12332 7

原创 解决:在conda环境中“install getorganelle”出现Solving environment: failed with initial frozen solve. 的报错。

GetOrganelle是建军和郁文彬老师开发的一款全新的细胞器基因组组装工具,此工具实现了大规模细胞器基因组的快速、准确的“自动化”安装。对于像我这样的初学小白来说,在使用这款工具时,最好先在虚拟机、服务器上安装miniconda3环境,然后在conda环境下使用(从GetOrganelle官网了解到截止2021.10.21,该软件还不支持在windows子系统上安装,但老师们在尽力匹配)。如何在虚拟机上安装miniconda3可以详细参考作者“夜晓岚渺渺”的《ubuntu 18.04下安装Minicon

2021-10-21 11:13:46 2429 3

空空如也

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