解决：在conda环境中“install getorganelle”出现Solving environment: failed with initial frozen solve. 的报错。

GetOrganelle是建军和郁文彬老师开发的一款全新的细胞器基因组组装工具，此工具实现了大规模细胞器基因组的快速、准确的“自动化”安装。对于像我这样的初学小白来说，在使用这款工具时，最好先在虚拟机、服务器上安装miniconda3环境，然后在conda环境下使用（从GetOrganelle官网了解到截止2021.10.21，该软件还不支持在windows子系统上安装，但老师们在尽力匹配）。如何在虚拟机上安装miniconda3可以详细参考作者“夜晓岚渺渺”的《ubuntu 18.04下安装Miniconda3 (pyton 3.7)，并配置conda环境》链接如下：ubuntu 18.04下安装Miniconda3 (pyton 3.7)，并配置conda环境_夜晓岚的博客-CSDN博客_ubuntu安装miniconda3  虽然我用的Ubuntu版本是16.04.7 -64位，python版本是3.8.5，但是亲测上述安装过程可用！很完整。

Miniconda3安装完成后输入命令行

1.conda create -n getorganelle  创建getorganelle环境

 这个getorganelle只是一个环境名称，只是为了好记，你也可以命名为getorganelle01 etc ，格式就是 conda create -n 环境名称

2.conda activate getorganelle   激活getorganelle

这时候可以看一下目前你conda中的有哪些环境

3.conda info --envs

显示出如下界面：

 显示目前你有一个base环境和getorganelle环境，表明你已经创建完成getorganelle环境，其实这一步你可以放在最前面做，我只是因为截图方便hhh

接下来就是安装getorganelle，也就是会出现标题问题的这一步，这一步真的是困扰了我这个小白很久，真的快崩不住了，好在最后终于解决。当输入命令行

4.conda install getorganelle

会出现这种报错

 显示在对应的镜像源中找不到getorganelle的包，你可以通过命令行

5.conda show channels  查看目前你的环境中有哪些可用的镜像源

一般你在没有添加其他源的情况下是只有一个默认源的，我添加了一个清华的源，具体操作步骤请看作者Jace写的《conda环境安装》，很详细！conda环境安装 - 收藏夹 - 知乎我试了清华的源还是不行，之后我试了conda环境的升级等等，conda环境升级还是有用的！

1.conda update -n base conda
2.conda update --all
连升级2次

第一次更新之后如上图

第二次更新如上图  

conda环境更新到最新版本之后，关键来了！！！

我又去重现审视了一下上面那篇《conda环境安装》中的镜像源，添加了这个中科大的镜像源，仅仅是因为看见它的不同之处，最后的文件夹目录里有个bioconda文件夹

6.conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

添加完这个镜像源之后，输入下面这个命令行，查看你添加的镜像源里有没有getorganelle的包，如果有的话一般就能安装成功！

7.conda search getorganelle

找到这个包了，顿时很兴奋！！！，因为之前都是这样的，在镜像源里根本找不到对应的包

接下来就是按部就班的，就直接在getorganelle环境里

1.conda install getorganelle

就行，最后结果如下：

然后因为安装getorganelle需要用到线粒体和叶绿体的参考序列库，上图中我最后一个命令就是下载参考序列库，接下来的步骤可以按照作者CJchen 生信扎记公众号《零基础教程：叶绿体基因组组装-Getorganelle》中的步骤来，链接在这里：零基础教程 | 叶绿体基因组组装 - GetOrganelle - 简书 (jianshu.com)

我也遇到了跟up主相同的问题，相信可以解决，ok，暂时更新到这里，生信小白，与大家一起学习，一起进步！！！