其实关于PGA软件在windows、linux和Mac里的下载、安装、配置和测试曲老师已经写得很清楚了,作为一个小白也是按照步骤一步步来就成功了,本篇主要是自己用于记录和之后方便查找之用,里面的链接大家参考
https://www.jianshu.com/p/6ac8a9fad9c9 ————>曲老师自己写的中文使用介绍
https://github.com/quxiaojian/PGA ————>软件GitHub网址
https://www.jianshu.com/p/1263a3c06a9b ————>windows下perl下载步骤
https://www.jianshu.com/p/2f125cdf8262 ————>windows本地版Blast下载安装
唯一值得注意是曲老师的PGA注释软件对于叶绿体基因组中的反式剪切基因rps12无法准确注释,需要在之后的手动校正中予以校正,其他都很棒!