生物信息学
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【生物信息学】scRNA-seq数据分析(一):质控~细胞筛选~高表达基因筛选
质控~细胞筛选~高表达基因筛选原创 2023-12-12 23:56:35 · 1481 阅读 · 0 评论 -
【机器学习】聚类(一):原型聚类:K-means聚类
本文介绍了聚类算法之原型聚类——K-means聚类原创 2023-11-24 18:43:15 · 762 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】单细胞RNA测序数据分析:计算亲和力矩阵(基于距离、皮尔逊相关系数)及绘制热图(Heatmap)
本文介绍了单细胞RNA测序数据分析:计算亲和力矩阵及其可视化:绘制热图(Heatmap)原创 2023-11-01 18:38:58 · 1598 阅读 · 0 评论 -
【论文复现】基于多模态深度学习方法的单细胞多组学数据聚类(【生物信息学】实验二:多组学数据融合:scMDC)
本文复现了:基于多模态深度学习方法的单细胞多组学数据聚类原创 2023-10-18 20:13:29 · 2256 阅读 · 13 评论 -
【生物信息学】使用皮尔逊相关系数进行相关性分析
本实验主要实现了自定义皮尔逊相关系数进行相关性分析。原创 2023-10-02 21:19:37 · 1414 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】Notears Linear算法在线性结构方程模型中的因果关系估计
本实验完成了Notears Linear算法在线性结构方程模型中的因果关系估计原创 2023-10-02 20:55:33 · 351 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】计算图网络中节点的中心性指标:聚集系数、介数中心性、度中心性
本实验实现了计算图网络中节点的中心性指标,包括聚集系数、介数中心性、度中心性等原创 2023-10-01 17:26:12 · 984 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】使用谱聚类(Spectral Clustering)算法进行聚类分析
本实验实现了使用谱聚类(Spectral Clustering)算法进行聚类分析原创 2023-10-01 17:09:51 · 729 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】使用HSIC LASSO方法进行特征选择
本实验实现了使用HSIC LASSO(Hilbert-Schmidt independence criterion LASSO)方法进行特征选择,并使用随机森林分类器对选择的特征子集进行分类。原创 2023-09-30 23:12:22 · 655 阅读 · 2 评论 -
【生物信息学】基因差异分析Deg(数据读取、数据处理、差异分析、结果可视化)
本实验完成了基因差异分析,成功识别出在正常样本与肿瘤样本之间显著表达差异的基因,并对其进行了进一步的可视化分析(箱型图、差异倍数fold分布图、热力图和散点图)。原创 2023-09-30 22:48:44 · 2351 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】基因富集分析enrichment
本实验完成了基因富集分析原创 2023-09-28 22:11:39 · 494 阅读 · 0 评论 -
【2023最新版】R安装(直接+Anaconda)及使用(Pycharm配置R)教程
R安装(直接+Anaconda)及使用(Pycharm配置R)教程原创 2023-08-23 22:19:18 · 5506 阅读 · 0 评论