linux服务器使用jupyter notebook时提示磁盘已满“Unexpected error while saving file:ipynb database or disk is full”

问题描述

使用ssh连接了实验室的linux服务器，在服务器上安装了jupyter notebook，但是使用没多久后一直提示内存已满。

问题解决

首先排查jupyter安装目录。因为我们实验室服务器的/home目录内存异常小，所有软件通常都需要安装在/data目录下，这就涉及到安装时更改安装目录的问题，可以参考一下别的文章。

排查后确定jupyter的workspace所在的/data目录磁盘空间没满，删除了同目录下一些没用的文件也没法解决，我就是这种情况，困扰了我好几天，隔一会发现又可以保存，第二天又连运行都运行不了。

查阅了大量网上资料，jupyter自带一个回收站，存放删除的文件，但是就算你安装jupyter在/data下，回收站的目录还是在/home下，一般是~/.local/share/Trash，虽然只有几百M大小，但就因为这几百M一直在爆内存。

解决方法是定期删除Trash中的file文件即可：

cd ~/.local/share/Trash
rm -rf files

更推荐一劳永逸的方法：直接修改jupyter的配置文件，把回收站功能关闭即可，这个功能现实中也没什么用。

vim ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py

找到

# c.FileContentsManager.delete_to_trash = True

将其修改为

c.FileContentsManager.delete_to_trash = False

重启jupyter notebook即可解决。