conda环境(生信环境搭建）

准备：配置 conda 镜像

1、安装conda镜像

​
# 添加 Anaconda 的 TUNA 镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
# 设置搜索时显示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes

​

首先通过代码生成配置文件 .condarc

conda config --set show_channel_urls yes

配置文件的目录是：~/.condarc, 使用vim打开它，并添加我们需要的源：

vim ~/.condarc

添加清华的源码

channels:
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
ssl_verify: true

2、命令行

列出当前所有的环境

conda info -e

创建一个虚拟环境

conda create -n name python=3.6 pandas=0.21

创建了一个名为name的新环境，同时安装了python 与 panda

激活环境

#win系统
activate name
#linux系统
source activate name

删除虚拟环境

conda remove -n name --all

conda clean -p #删除缓存

conda clean -y --all #删除pkgs目录下所有无用的安装包及cache

复制一个环境

conda create -n new_name  --clone old name