HCP数据集相关

已于 2022-10-17 15:04:39 修改
阅读量2.5k 收藏 11
点赞数 3
分类专栏： HCP数据库相关 文章标签： 青少年编程
于 2022-10-09 11:51:31 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/m0_73727340/article/details/127220989
版权
本文档详细介绍了如何下载Human Connectome Project（HCP）的3T数据，包括通过官方网站和AWS3两种方式，以及下载过程中的注意事项。同时，提供了数据集的目录结构、扫描操作流程和关键参数，如rsfMRI的TR、切片数量等信息，为研究者使用HCP数据集提供参考。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

一、下载

（一）脑影像下载

1.官网

        （1）HCP官网：Connectome - Homepage

2.下载地址：ConnectomeDB

    注：要先按照流程下砸HCP需要的 下载插件

                [1]先注册登陆

                [2]点击选择想要下载的库

选择：3T数据

选择想下载的类别：

 在右方选择需要的包进行下载

 

最低0.47元/天 解锁文章
人类连接组项目(HCP)的纤维束测量：资源和见解
u011661076的博客
07-08 1415
摘要 人类连接组项目(HCP)已成为人类神经科学研究的基石，在推进脑成像方法和了解人脑方面具有重要作用。本研究专注于对HCP的扩散加权磁共振成像(dMRI)数据进行纤维示踪分析。使用了一个开源软件库(pyAFQ；https://yeatmanlab.github.io/pyAFQ)进行概率纤维束成像并描绘具有完整dMRI采集(n=1041)的HCP受试者的主要白质通路。本研究使用弥散峰度成像(DKI)对每个体素中的白质微结构进行建模，并提取沿束长度的DKI衍生组织特性的束轮廓。本研究探索了以下方面：首先，
MRI 数据（HCP数据及其他）
lxqlxq21的专栏
05-09 9143
HCP预处理pipeline：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23668970文件夹结构以及每个文件是什么：http://www.humanconnectome.org/documentation/S500/HCP_S500+MEG2_Release_Reference_Manual.pdf dtseries.nii是皮层数据，大小大概只有64k两个工具箱：
HCP数据集下载
hanshuning的专栏
10-13 5049
下载地址（需要先注册）： https://db.humanconnectome.org/app/template/Index.vm 点击open datasets: documents 如下，reference manual 很重要（也可以在上图中下载manual），里面有详细的相关介绍，包括如何下载数据： https://humanconnectome.org/study/hcp-young-adult/document/1200-subjects-data-release/ 选择explore s
Human Connectome Project（HCP）数据集官网下载
weixin_53675732的博客
10-06 1472
我下载这个插件的过程非常之痛苦灾难，下载过程中遇到了个麻烦（也不知道这是我个人遇到的问题，还是通病）我个人能力咋解决也解决不了，最后没办法上某宝下单远程操控让别的大佬帮忙把这个软件安上了。（只下载个人数据真的还挺重要的，因为全部数据真的好大，随随便便就上百GB了，非常之占用内存，如果只想简单学习数据预处理的话，很建议就先下载一个人的数据来练练手）基础的教程这个连接里都有，但我还是写了这篇文，主要是想分享一下，我踩的坑，希望大家能避开。就很奇怪，因为我第一天一直连不上，第二天再试就又能连上了。
HCP_S1200数据集下载
lyp
01-23 2544
HCP_dataset Mapping the human brain is one of the great scientific challenges of the 21st century. The HCP( The Human Connectome Project) is mapping the healthy human connectome by collecting and freely distributing neuroimaging and behavioral data on 1,20
Data Tour: Human Connectome Project (HCP)数据下载
lazysnake666的博客
02-12 5506
第一次下载还是容易迷路，这里记录申请和下载HCP数据大概流程。imaging数据下载1. 之前似乎还有一个注册的步骤。2. 注册好之后，可以登录到ConnectomeDB的页面即可，看到如...
HCP数据集 - HCP手册
11-08
HCP数据集（Human Connectome Project数据集）是由美国国立卫生研究院资助的研究项目，旨在通过高分辨率成像技术绘制出人类大脑连接的详细图谱，并公开这些数据以供全球科学研究人员使用。该数据集包含了丰富的神经...
ciftify:人类Connectome项目（HCP）的工具适用于处理非HCP数据集
05-05
人类Connectome项目（HCP）的工具适用于处理非HCP数据集 ciftify是一组三种类型的命令行工具： ：适用于HCP的命令行工具最小的处理管道，可将预处理的T1和fMRI数据放入类似HCP的文件夹结构中 ：用于简化cifty格式的...
matlab终止以下代码-hcp-diffusion-dcm:在我的博士实验2中使用的脚本，在HCP数据集上使用tractography和DC
05-21
matlab终止以下代码HCP扩散DCM实验 目录 关于 该项目 该项目是我在昆士兰州脑研究所的博士与我的主管玛塔·加里多博士和杰森·马汀利教授合作的第二个实验。 现在已在eLife中发布： McFadyen，J.，Mattingley，JB，...
HCP数据集
最新发布
03-17
### HCP 数据集的下载与使用 HCP（Human Connectome Project）数据集是一个公开可用的大规模神经科学数据库，旨在研究人类大脑的功能和结构连接性[^1]。该数据集提供了丰富的多模态成像数据，包括静息状态功能磁...
HCP_MRI-behavior:使用来自年轻成人人类Connectome项目的数据来预测来自静止状态fMRI功能连接的行为变量（例如，智力，人格）的个体差异的代码
05-22
HCP_MRI行为 用于使用来自年轻成人人类Connectome项目的数据来预测来自静止状态fMRI功能连接的行为变量（例如，智力，人格）中个体差异的代码。 该代码取决于HCP数​​据结构。 可从HCP网站（ ）获得HCP数据（MRI和行为/人口统计学） 作者：Julien Dubois（ ）和Paola Galdi（ ） 该代码按原样提供，用于文档目的。 包括以下文件： HCP_helpers.py ：包含所有助手功能和模块导入，用于静态fMRI预处理和行为预测 person.ipynb ：重现以下内容的分析： Dubois，J。*，Galdi，P。*，Han，Y.，Paul，LK和Adolphs，R。静止状态的功能性大脑连通性最能预测开放性的人格维度。 人格神经科学，印刷中。 预印本： : Intelligence.ipynb ：在以下位置重现分析 Dubois，
HCPpipelines：HCP的处理管道
02-05
HCP管道 HCP Pipelines产品是用于处理MRI图像的一组工具（主要但不是唯一地，shell脚本）。 这些工具除其他外，还实现了所述的最小预处理管道（MPP） 有关更多信息，请参见： 当前文档， 项目中的其他文档 有关HCP管道使用和改进的讨论可以发布到hcp-users讨论列表中。 在注册hcp-users
MRI大脑数据
12-13
通过MRI扫描得到的人体大脑图像，用于医学影像分析和三维重建。
HCP图画法概要
09-28
日本对模块的执行流程一般用HCP图来描述，国内很少用HCP图表示，本文档简单介绍hcp图的各元素意义
使用IBM Aspera批量下载HCP数据
Tonyslp的博客
10-25 1674
HCP数据集的下载步骤，以及头动文件和CSF文件的所在位置
HCP_DataLoader
lyp
01-23 520
from torch.utils.data import Dataset,DataLoader import torch import numpy as np import nibabel as nbl HCPDataListPath = '/home/ec2-user/SageMaker/Models_HCP/dt.txt' HCPDataRootPath = '/home/ec2-user/SageMaker/HCP_dataset' labelNumber = {'EMOTION': 0, 'GAM
HCP；IDA；ABIDE（孤独症）磁共振数据库下载
xxx
06-02 1103
ABIDE；HCP；IDA
数据库
cv_family_z的博客
12-29 1830
人脸数据库 关注博客：http://haoxiang.org/2013/12/face-recognition-detection-database/ 香港的CelebA： http://mmlab.ie.cuhk.edu.hk/projects/CelebA.html WIDERFACE: http://mmlab.ie.cuhk.edu.hk/projects/WIDERFace/
Human Connectome Project (HCP) Dataset loader网址翻译
qq_41238579的博客
09-12 3815
地址： https://nbviewer.jupyter.org/github/NeuromatchAcademy/course-content/blob/master/projects/load_hcp.ipynb 人类Connectome Project（HCP）数据集 HCP数据集包括大量的被试样本，包括静息态和基于任务的功能磁共振成像。 NMA整理的数据集包括时间序列数据，这些数据已通过在360个感兴趣的区域内进行汇总而进行了预处理和空间降采样。 #导入相应的包 import os import
评论 3
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值