HCP数据集相关

已于 2022-10-17 15:04:39 修改
阅读量1.7k 收藏 8
点赞数 2
分类专栏： HCP数据库相关 文章标签： 青少年编程
于 2022-10-09 11:51:31 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/m0_73727340/article/details/127220989
版权
本文档详细介绍了如何下载Human Connectome Project（HCP）的3T数据，包括通过官方网站和AWS3两种方式，以及下载过程中的注意事项。同时，提供了数据集的目录结构、扫描操作流程和关键参数，如rsfMRI的TR、切片数量等信息，为研究者使用HCP数据集提供参考。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一、下载

（一）脑影像下载

1.官网

        （1）HCP官网：Connectome - Homepage

2.下载地址：ConnectomeDB

    注：要先按照流程下砸HCP需要的 下载插件

                [1]先注册登陆

                [2]点击选择想要下载的库

选择：3T数据

选择想下载的类别：

 在右方选择需要的包进行下载

 

最低0.47元/天 解锁文章
DW爱学习
关注
  • 2
    点赞
  • 踩
  • 8
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 3
    评论
专栏目录
HCP；IDA；ABIDE（孤独症）磁共振数据库下载
xxx
06-02 98
ABIDE；HCP；IDA
结构MRI、静息态MRI(fMRI)、任务态fMRI、MEG、EEG公开数据库汇总
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
08-01 5685
（1）人脑连接组计划（HCP），该数据库目前被试数约1200人，包括结构MRI、静息态MRI、任务态fMRI、MEG等数据模态，其他数据还包括人口统计学数据、神经心理学数据、基因数据。 网址：http://www.humanconnectome.org/ （2）1000功能连接组计划(1000 Functional Connectomes Project, FCP)，包括结构MRI和静息态fMRI数据，此外还包括人口统计学数据。 网址：http://fcon_1000.projects.nitrc.org/
HCP数据集下载
hanshuning的专栏
10-13 3927
下载地址（需要先注册）： https://db.humanconnectome.org/app/template/Index.vm 点击open datasets: documents 如下，reference manual 很重要（也可以在上图中下载manual），里面有详细的相关介绍，包括如何下载数据： https://humanconnectome.org/study/hcp-young-adult/document/1200-subjects-data-release/ 选择explore s
Data Tour: Human Connectome Project (HCP)数据下载
lazysnake666的博客
02-12 2966
第一次下载还是容易迷路，这里记录申请和下载HCP数据大概流程。imaging数据下载1. 之前似乎还有一个注册的步骤。2. 注册好之后，可以登录到ConnectomeDB的页面即可，看到如...
HCP_S1200数据集下载
lyp
01-23 2253
HCP_dataset Mapping the human brain is one of the great scientific challenges of the 21st century. The HCP( The Human Connectome Project) is mapping the healthy human connectome by collecting and freely distributing neuroimaging and behavioral data on 1,20
matlab终止以下代码-hcp-diffusion-dcm:在我的博士实验2中使用的脚本，在HCP数据集上使用tractography和DC
05-21
matlab终止以下代码HCP扩散DCM实验 目录 关于 该项目 该项目是我在昆士兰州脑研究所的博士与我的主管玛塔·加里多博士和杰森·马汀利教授合作的第二个实验。 现在已在eLife中发布： McFadyen，J.，Mattingley，JB，和Garrido，MI（2019）。 从枕骨到杏仁核的传入白质通路有助于恐惧识别。 eLife，8，e40766。 我们的研究问题是，“有什么证据表明人体内杏仁核存在结构性皮下途径？” 数据 为了充分回答这个问题，我们利用了免费提供的人类Connectome项目（）。 我们使用了S900版本，其中包含大约900名年龄在18至35岁之间的参与者，他们参加了HCP的一系列测试。 所有参与者的数据均在美国圣路易斯的华盛顿大学收集。 S900版本中的数据存储在高性能计算平台上，该平台位于澳大利亚墨尔本的莫纳什大学。 与澳大利亚研究委员会的隶属关系使之成为可能。 由于该项目的计算量很大，因此我们对M3进行了分析，还通过将数据从M3传输到澳大利亚布里斯班昆士兰大学昆士兰大脑研究所的集群计算系统进行了分析。 我们被允许潜在地识别人口统计信息，以便我们可以获得与
HCP_DataLoader
lyp
01-23 454
from torch.utils.data import Dataset,DataLoader import torch import numpy as np import nibabel as nbl HCPDataListPath = '/home/ec2-user/SageMaker/Models_HCP/dt.txt' HCPDataRootPath = '/home/ec2-user/SageMaker/HCP_dataset' labelNumber = {'EMOTION': 0, 'GAM
MRI 数据（HCP数据及其他）
lxqlxq21的专栏
05-09 8616
HCP预处理pipeline：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23668970文件夹结构以及每个文件是什么：http://www.humanconnectome.org/documentation/S500/HCP_S500+MEG2_Release_Reference_Manual.pdf dtseries.nii是皮层数据，大小大概只有64k两个工具箱：
数据库
cv_family_z的博客
12-29 1793
人脸数据库 关注博客：http://haoxiang.org/2013/12/face-recognition-detection-database/ 香港的CelebA： http://mmlab.ie.cuhk.edu.hk/projects/CelebA.html WIDERFACE: http://mmlab.ie.cuhk.edu.hk/projects/WIDERFace/
Human Connectome Project (HCP) Dataset loader网址翻译
qq_41238579的博客
09-12 3389
地址： https://nbviewer.jupyter.org/github/NeuromatchAcademy/course-content/blob/master/projects/load_hcp.ipynb 人类Connectome Project（HCP）数据集 HCP数据集包括大量的被试样本，包括静息态和基于任务的功能磁共振成像。 NMA整理的数据集包括时间序列数据，这些数据已通过在360个感兴趣的区域内进行汇总而进行了预处理和空间降采样。 #导入相应的包 import os import
CASIA数据集免费分享
03-11
CASIA数据集免费分享
HCP_MRI-behavior:使用来自年轻成人人类Connectome项目的数据来预测来自静止状态fMRI功能连接的行为变量（例如，智力，人格）的个体差异的代码
05-22
HCP_MRI行为 用于使用来自年轻成人人类Connectome项目的数据来预测来自静止状态fMRI功能连接的行为变量（例如，智力，人格）中个体差异的代码。 该代码取决于HCP数​​据结构。 可从HCP网站（ ）获得HCP数据（MRI和行为/人口统计学） 作者：Julien Dubois（ ）和Paola Galdi（ ） 该代码按原样提供，用于文档目的。 包括以下文件： HCP_helpers.py ：包含所有助手功能和模块导入，用于静态fMRI预处理和行为预测 person.ipynb ：重现以下内容的分析： Dubois，J。*，Galdi，P。*，Han，Y.，Paul，LK和Adolphs，R。静止状态的功能性大脑连通性最能预测开放性的人格维度。 人格神经科学，印刷中。 预印本： : Intelligence.ipynb ：在以下位置重现分析 Dubois，
HCPpipelines：HCP的处理管道
02-05
HCP管道 HCP Pipelines产品是用于处理MRI图像的一组工具（主要但不是唯一地，shell脚本）。 这些工具除其他外，还实现了所述的最小预处理管道（MPP） 有关更多信息，请参见： 当前文档， 项目中的其他文档 有关HCP管道使用和改进的讨论可以发布到hcp-users讨论列表中。 在注册hcp-users
ciftify:人类Connectome项目（HCP）的工具适用于处理非HCP数据集
05-05
细化 人类Connectome项目（HCP）的工具适用于处理非HCP数据集 ciftify是一组三种类型的命令行工具： ：适用于HCP的命令行工具最小的处理管道，可将预处理的T1和fMRI数据放入类似HCP的文件夹结构中 ：用于简化cifty格式的命令行工具 ：可视化工具，这些工具使用connectome-workbench工具在fRML页面中一起创建当前主题的标准视图的png。 请查看我们的Wiki，以获取有关各个工具的更多详细信息！ 下载并安装 安装最新版本的python软件包 首先，安装python软件包及其所有捆绑的数据和脚本。 您可以使用一个带有pip的命令执行此操作。 请注意，最新版本的ciftify需要python 3（不再支持python 2）。 要使用pip进行安装，请在终端中键入以下内容。 pip install ciftify 有关其他安装选项，请参阅
MRI大脑数据
12-13
通过MRI扫描得到的人体大脑图像，用于医学影像分析和三维重建。
HCP图画法概要
09-28
日本对模块的执行流程一般用HCP图来描述，国内很少用HCP图表示，本文档简单介绍hcp图的各元素意义
hcp-CCA算法
05-08
典型相关分析是一种多元统计方法，它旨在寻找两个多变量数据集之间的最大相关性。在fMRI研究中，这些数据集可能是不同脑区在时间上的激活模式。通过CCA，可以识别出两组变量间最强的相关结构，帮助科学家理解大脑...
基于深度扩散模型的自监督弥散 MRI 去噪内含数据集和环境搭建教程.zip
最新发布
05-01
在数据集方面，我们使用了公开的弥散MRI影像数据集，如ISBI、HCP等，并进行了预处理，包括图像增强、分割和特征提取等。在环境搭建方面，我们使用Python编程语言，基于TensorFlow、PyTorch等深度学习框架进行开发。...
多标签分类(十一):HCP: A Flexible CNN Framework for Multi-Label Image Classification
weixin_43436958的博客
11-12 1963
HCP:灵活的CNN多标签图像分类框架 摘要   卷积神经网络(CNN)在单标签图像分类任务中表现出了良好的性能.但是CNN如何最好的处理多标签图像仍然是一个有待解决的问题，主要是由于底层对象布局复杂，多标签训练图像不足.在这项工作中，我们提出了一种灵活的深度CNN基础架构，称为Hypotheses-CNN-Pooling（HCP），其中将任意数量的对象段假设作为输入，然后将共享的CNN与每个假设连接，最后是CNN 将来自不同假设的输出结果与最大池合并，以生成最终的多标签预测.这种灵活的深度 CNN基础设施
hcp1200数据集是干嘛的
09-05
hcp1200数据集是一个用于研究人类连接组（Human Connectome Project）的数据集。该数据集包含了1206个被试者的大脑成像数据，包括结构磁共振成像（sMRI）和功能性磁共振成像（fMRI）数据。这些数据可以用于分析和探索人类大脑的结构和功能连接，以及研究与神经科学相关的问题。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 3
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值