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原创 MEFA(Molecular EvolutionaryGenetics Analysis)的使用

此外,可利用PhyML ( http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/ )在线分析软件进行系。1.序列获取(在ncbi中获取FASTA格式的蛋白序列文件。进入官网进行点击 DOWNLOAD 下载。下图要点NO才可以进入FALST格式。(一)利用MEGA4构建系统发育树。2.使用MEGA进行多序列比对。自此十三个序列数据下载完成。

2024-05-27 15:53:12 144

原创 spss使用方式

下图可以看到minimum(最小数据)和maximum(最大数据)这里和下面的设置起始位置和组距有很大关系。完成所有设置以后,记得点击make labels(之前是<=,点击后变成<)pp图,qq图,若符合正态分布,则散点应和直线在一条线上。点击 make cutpoints...不要一味看p值,要看pp图和qq图。进去设置频数分布表的起始和组距。点击statistics。

2024-05-22 16:03:29 180

原创 用SSMS工具创建数据库

重启方式:进入“此电脑”中,点击鼠标右键,点击“显示更多选项”添加class 添加classname唯一键。右键单击SQL Server选择重新启动。添加sscore CHECK约束。点击“服务”和“server”点击SQL Server服务。

2024-05-22 16:02:23 109

原创 Windows Subsystem for Linux(WSL)----Ubuntu安装指南

8.安装完成后,点击启动,首次启动,需要输入用户名,并为该用户名设置密码,需要注意的是,两次输入密码需要一致,且在输入密码时,系统不会有回显。9.在Windows Power Shell中输入wsl -l -v可以查看WSL的版本。这样,WSL2安装完成。在ubuntu中,使用df –h可以看到宿主机的磁盘已经被挂载到WSL中的Ubuntu的 /mnt 目录下。1.硬件虚拟化:开启电脑的虚拟化,可在:任务管理器->性能->CPU下查。完全未安装WSL时,输入wsl --install命令,然后重启计算机。

2023-09-04 21:14:55 907 1

原创 cmd中更改盘幅

4.进入到ip地址连接的8787网站中就可以在右下角的Files(文件)中找到work就可以看到移到了该处,然后在左下角Terminal处,使用命令cd work更改路径到work,然后输入命令unzip 需要解压缩文件的名字(使用Tab)键补齐。1.首先在ubuntu中进行安装mkdir work,记得更改路径。格式:scp ./*用户名@ip地址:/home/用户名/work。3.打开后,在储存文件地址中输入以下命令。注:解压缩文件名在work文件中最后一个。2.到该文件储存地方进行cmd形式打开。

2023-09-04 19:13:15 77 1

原创 利用VirtualBox和Ubuntu启动Rstudio-server

则使用sudo apt install net-tools进行安装后再次输入ifcondig进行查看ip地址。使用解决方案中第三个网址进行链接下载(从第二步开始到第四步第一排结束)点击电脑菜单键,搜索控制面板,进入面板后,按着下面的流程走进行设置。现在就可以打开cmd输入ssh 用户名@ip地址就连接成功啦!接下来在ubuntu中输入ifconfig命令查看ip地址。1.首先进入VirtualBox,跟着下面的操作进行。然后打开电脑的cmd(Windows系统)点击确定后,进入下面的界面。

2023-08-30 23:09:15 262

原创 环境变量与全局变量

如果要给变量赋一个含有空格的字符串值,必须用单引号来界定字符串的首和尾。所有的环境变量名均使用大写字母,这是bash shell的标准惯例。显示环境变量的当前值,这个值和父shell中的一模一样。全局环境变量对于shell会话和所有生成的子shell都是可见的。修改子shell中环境变量并不会影响到父shell中该变量的值。1. 进入子shell中查看父shell中设置的全局环境变量。5. 退出子shell,查看父shell中的该变量值。3. 退出子shell,查看父shell中的该变量值。

2023-08-30 10:29:37 87

原创 安装R以及Rstudio的安装

3.输入R,即可进入R界面,根据1的连接里面1.3里面进行安装,要验证该包是否安装成功,输入library( ),括号里面的内容为该包对应的括号不加引号内容。该报错处理方法:BiocManager::install("SingleCellExperiment", force = TRUE)4. 在安装过程中,系统可能会要求您提供管理员密码进行确认。1. 打开终端:您可以使用快捷键Ctrl + Alt + T打开终端。如果成功安装,您将看到R的版本信息。不成功,可以输入以下命令后继续安装。

2023-08-30 09:34:45 289

原创 理解shell

命令分为内建命令和外部命令。非内建(外部)命令:有时候也被称为文件系统命令,是存在于bash shell之外的程序。外部命令程序通常位于/bin、/usr/bin、/sbin或/usr/sbin中。外部命令ps很方便显示出它的父进程以及自己所对应的衍生子进程。它在后台生成一个子shell,并在这个子shell中执 行命令。后台模式:运行命令可以在处理命令的同时让出CLI,以供他用。要想将命令置入后台模式,可以在命令末尾加上字符&命令列表命令包含在括号里,生成一个子shell来执行对应的命令。

2023-07-19 00:29:05 33

原创 更多的 bash shell 命令

从左到右名称:UID:启动用户;PPID:父进程ID;STIME:启动时间;TIME:累计CPU时间;CMD:启动程序名称。从左到右:进程ID;进程占用虚拟内存总量,进程占用物理内存总量;进程使用CPU时间比例;此处无法实现的原因在于我的目录下面没有该文件,可以使用mkdir新建一个。实时显示,用ctrl+C退出。详情见 挂载U盘处连接。

2023-07-19 00:17:17 60

原创 使用结构化命令

2.输入命令./else.sh 若该命令执行失败,可能是由于权限不够,输入命令ls -l else.sh查看权限,若没有x的权限,那么需要输入命令chmod +x else.sh 该命令为添加可执行权限,进而再输入./else.sh命令即可执行。2.输入命令./if.sh 若该命令执行失败,可能是由于权限不够,输入命令ls -l if.sh查看权限,若没有x的权限,那么需要输入命令chmod +x if.sh 该命令为添加可执行权限,进而再输入./if.sh命令即可执行。

2023-07-18 23:55:43 53 1

原创 理解Linux文件权限

3. 用默认系统参数创建一个新用户账户,然后检查一下新用户的HOME目录。4. 用-m参数创建一个新用户账户,检查新用户的HOME目录。根据上图 drwx的意思分别为:文件,可读,可写,可执行。options的-R选项可以让权限的改变递归地作用到文件和。2. 根据前一章的内容,解释目录下的文件是做什么的。4. 修改用户/etc/passwd文件的备注字段。owner.group 同时改变文件的属主和属组。变文件的属组,但前提是属主必须是原属组和目标属组。1. 查看/etc/skel下的文件。

2023-07-17 13:22:36 80 1

原创 构建基本脚本

有些时候你想要保存某个命令的输出,bash shell提供了几个操作符,可以将命令的输出重定向到另一个位置(比如文件)。重定向可以用于输入,也可以用于输出, 可以将文件重定向到命令输入。shell通过PATH环境变量来查找命令,目前该命令还无法运行,需要执行将shell脚本文件所处的目录添加到PATH环境变量中 或 ②在提示符中用绝对或相对文件路径来引用shell脚本文件。输入重定向将文件的内容重定向到命令,而非将命令的输出重定向到文件。wc命令可以对对数据中的文本进行计数。

2023-07-12 10:27:05 87 1

原创 Linux环境变量

所有的环境变量名均使用大写字母,这是bash shell的标准惯例。ENV 如果设置了该环境变量,在bash shell脚本运行之前会先执行已定义的启动文件(仅用于当bash shell以POSIX模式被调用时)用printenv显示某个变量的值除外)显示环境变量的当前值,这个值和父shell中的一模一样。全局环境变量对于shell会话和所有生成的子shell都是可见的。修改子shell中环境变量并不会影响到父shell中该变量的值。1. 进入子shell中查看父shell中设置的全局环境变量。

2023-07-10 11:50:29 116 1

原创 编辑器的练习

2. 在编辑器中完成《如何使用vim编辑器操作指南》,内容应至少包括: ① 学号 姓名;3. 执行如下操作: ① 查找你的姓名/学号 ② 替换文件中全部vim为vi(或替换vi为vim)第四步:在普通模式下,输入命令:%s/old/new 然后enter即可将旧内容改变成新内容,若要改变一行,则输入命令:%s/old/new/g 即可。输入i进入编辑模式,输入ESC退出编辑模式进入普通模式。num G:移动到缓冲区中的第num行。j:下移一行(文本中的下一行)。k:上移一行(文本中的上一行)。

2023-07-10 11:04:51 246 1

原创 Windows Subsystem for Linux (WSL)中使用的命令,用于将Windows驱动器挂载到Linux中 的挂载过程

第八步:输入命令 sudo mount -t drvfs E: /mnt/usb 也就是将在Windows系统中的E盘挂载到mnt中的usb中,输入命令df -h可以查看到现在u盘的状况,通过和上面未挂载u盘的状况相对比,可以发现,挂载u盘成功。第九步:当u盘挂载成功后,需要使用 sudo umount /mnt/usb 命令来卸载已挂载好的u盘。目录下创建一个新的文件夹,创建后,可利用pwd加cd加ls命令查看是否创建成功。第五步:输入命令 sudo fdisk -l 来查看系统识别到的存储设备列表。

2023-07-07 11:42:45 782

原创 Ubuntu练习上的小知识点

Cd w文件名/ 进入该文件夹。nohup ping 挂载起来运行。nohup.out 查看报错信息。Pwd 展示你现在的工作目录。Ls 列出当前文件夹所有的内容。Which ps 查看进程。cctrl c 停止运行。-> 实际访问后面的文件。全部都是查看当前目录。Mkdir 新建目录。Cd .. 后退目录。

2023-07-07 10:01:51 38

原创 VirtualBox安装指南

虚拟机广泛应用于服务器虚拟化、开发和测试环境、云计算和容器化等领域,为企业和个人提供了更大的灵活性和效率。清华大学开源软件镜像站,致力于为国内和校内用户提供高质量的开源软件镜像、Linux 镜像源服务,帮助用户更方便地获取开源软件。第五步:做好第四步以后,点击进入以及安装好的页面里,点击工具栏,然后出现扩展,随后点击扩展,选中拓展后出现的事务。(若启动出现异常,可以去到文件资源管理器中,找到VirtualBox文件夹,对其进行属性的修改)第十二步:完成上述步骤以后,点击完成,并返回主页面,点击。

2023-07-05 00:03:42 5480 1

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