安装R以及Rstudio的安装

1.点击网址Introduction to Single-Cell Analysis with Bioconductor进入安装步骤

2.输入命令

      1.sudo apt-get install r-base # Debian/Ubuntu
       2.sudo dnf install R # Fedora/CentOS/RHEL
       3.sudo yum install R # older Fedora/CentOS/RHEL

实施步骤1时，

您可以按照以下步骤在Ubuntu上安装R：

      1. 打开终端：您可以使用快捷键Ctrl + Alt + T打开终端。

       2. 输入以下命令以更新软件包列表：
             sudo apt update
       3. 然后，输入以下命令以安装R：

                 sudo apt install r-base
       4. 在安装过程中，系统可能会要求您提供管理员密码进行确认。输入密码并按Enter键继续。

      5. 完成安装后，您可以通过输入以下命令来验证R是否成功安装：

                  R --version
如果成功安装，您将看到R的版本信息。

3.输入R，即可进入R界面，根据1的连接里面1.3里面进行安装，要验证该包是否安装成功，输入library(    ),括号里面的内容为该包对应的括号不加引号内容。

1.3中第三步遇到的问题

上图代表安装成功 

若安装

BiocManager::install("SingleCellExperiment")

不成功，可以输入以下命令后继续安装

 q()

 sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libxml2-dev

sudo R

 BiocManager::install("SingleCellExperiment")

该报错处理方法：BiocManager::install("SingleCellExperiment", force = TRUE)

 该报错处理方法：install.packages("BiocManager")

                              BiocManager::install("SingleCellExperiment")

BiocManager::install("SingleCellExperiment") Error in loadNamespace(x) : there is no package called ‘BiocManager’

第四步安装

上图代表第四步安装成功 

5.安装rstudio

可能的报错

链接1：

wget http://security.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/o/openssl/libssl1.0.0_1.0.2g-1ubuntu4.20_amd64.deb

sudo dpkg -i libssl1.0.0_1.0.2g-1ubuntu4.20_amd64.deb

sudo gdebi rstudio-1.1.414-amd64.deb
 

若以上报错解决方法不行

可能是版本不同

使用第一张图的第三个命令，而不是去参照连接1的第一个命令链接1和2完成后，输入完整安装流程后，进行验证

验证安装完成出现以下界面