MEFA(Molecular EvolutionaryGenetics Analysis)的使用

1.搜索 Home (megasoftware.net) 进入官网进行点击 DOWNLOAD 下载

(一)利用MEGA4构建系统发育树

1.序列获取(在ncbi中获取FASTA格式的蛋白序列文件

其中 遇到了  原鸡 报错,解决方案如下:

下载序列方式流程如下:

自此十三个序列数据下载完成。

2.使用MEGA进行多序列比对

选择Protein

进入页面

下图要点NO才可以进入FALST格式

选择第三个

此外,可利用PhyML ( http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/ )在线分析软件进行系
统发育树的构建

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