Mac OS 安装Ambertools14

     为了安装ambertools14，需要编译器gcc和MPI mpich。但是mac系统里面默认的

apple版的gcc无法用来编译ambertools14. 所以最好使用最新版本GNU版本的gcc。

按照官方教程， 使用软件包管理软件Macport来进行这两个软件的安装。

    (1). 首先 www.macports.org/ 下载pkg文件，直接安装，完毕后安装。

    (2). 编译安装 gcc49 和MPICH3

	sudo port install gcc49
	sudo port install mpich-gcc49
	sudo port select --set gcc mp-gcc49
	sudo port select --set mpi mpich-gcc49-fortran

     其中后两步分别是设置gcc49，和MPICH作为默认的gcc编译器，以及MPI。

    (3).  编译安装 Ambertools，直接按照README进行即可，

说明：Macport和不同之处在于前者安装软件全都是下载源代码，编译安装，所以会很

慢，且安装默认路径在/opt/local。而homebrew则会优先寻找已编译好的二进制包，如

果找不到才下载源代码安装。因此homebrew更加方便。但是这次使用homebrew安装

gcc49，如果用homebrew继续安装mpich的话，homebrew为了兼容性默认使用Clang

来编译，这样会在安装amber时候带来库无法连接的错误。以及homebrew无法设置默

认的gcc以及mpi，不是很方便。