blast2go下载和本地安装

最新推荐文章于 2022-06-26 16:31:54 发布
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分类专栏： Blast2GO

https://www.blast2go.com/support/testimonials

https://www.blast2go.com/support/blog/22-blast2goblog/110-local-blast2go-database-installation

python blast在线比对 每天最多数万条
liberal_wind的博客
09-05 5826
python blast在线比对、每天可达数万条 背景：在碱基序列，如 TRINITY_DN931509_c0_g1_i1 GCACGTTCTTCTCGATGCTGACGGAGCGAGGCGCGCTGGCGGAGCTGATGGC GGCGCAGCTGGAGCGAGGGCGCACGCCGCGGGTGCGCCGGCGCCGGCCGC GCCCCAGGCCCAGGGCCAGG...
如何利用linux分析转录组数据库,对转录组测序数据进行分析以及注释
weixin_30111277的博客
05-09 1483
随着二代测序技术的高速发展，人们获得了大量的转录组数据序列如何从数据中挖掘具有生物意义的信息已经成为很多研究的关键，对未知基因的功能进行预测和注释就是一个重要问题这篇文章主要是跟着 刘粉香，杨文国，孙勤红，三位老师的文献对测序数据进行分析以及GO注释，旨在学习测序数据分析的方法以及GO注释的方法数据来源于NCBI上的SRA数据库 SRR0637841.原始测序数据下载与质控#下载数据~/.aspe...
本地Blast2GO安装
mengjiaoduan的博客
07-31 505
http://blog.csdn.net/tmjdone/article/details/6890897 http://blog.sina.com.cn/s/blog_3f69725901010i3z.html
Blast2GO_windows_4_0.exe
09-06
对核酸，或者蛋白序列进行在线比对分析，然后针对于序列相似度或者保守性进行注释，功能富集
blast2go mysql_Blast2go本地化教程
weixin_39822923的博客
01-26 265
idmapping.tb.gz、go_201307-assocdb-data.gz2.本地化架构由于blast2go数据库太大，请务必将my.ini文件的datadir设置到一个空间足够的磁盘，例如我的E盘有100G可用空间，设置如下：datadir="E:/MySQL/MySQL Server 5.6/data\"由于MYSQL5.x是不允许BLOB/TEXT类型的字段拥有默认值的，且在wind...
blast2go mysql_blast2go本地数据库安装和使用
weixin_30746795的博客
01-20 666
1. Download all necessary files$ wget -c -b -N --progress=dot:mega http://archive.geneontology.org/latest-full/go_201310-assocdb-data.gz$ wget -c -b -N --progress=dot:mega ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/g...
搭建本地blast2go
tmjdone的专栏
10-20 4820
1. 从http://www.blast2go.com/b2glaunch/resources  下载相应资源( http://www.blast2go.com/data/blast2go/b2g4pipe_v2.5.zip http://www.blast2go.com/data/blast2go/local_b2g_db_tutorial_0809.zip ) 1.5 (可选,依据
blast2go mysql_从 Blast2GO 本地化聊一聊 Linux 下 MySQL 的源码安装
weixin_39926042的博客
01-20 313
Blast2GO 是一个基于序列相似性搜索的 GO 注释和功能分析工具，它可以直接统计分析基因功能信息，并可视化 GO 有向非循环图(DAG)上的相关功能特征，分析 BLAST、GO-mapping、GO 注释分析和富集分析结果。Blast2GO Command Line (CLI) 的使用需要满足 Java 与 MySQL 的预安装。Blast2GO Command Line (CLI) is ...
Go 相关的框架，库和软件的精选清单
开发之路
07-03 5697
概述 这是一个Go 相关的框架，库和软件的精选清单，引用自 awesome-go项目，并翻译补充而来这是一个Go 相关的框架，库和软件的精选清单，引用自 awesome-go项目，并翻译补充而来 音频和音乐 用于处理音频的库。 EasyMIDI -EasyMidi是一个简单可靠的库，用于处理标准Midi文件（SMF）。 flac支持FLAC流的Native Go FLAC编码器/...
【全面揭秘】：深入理解Proteome Discoverer 2.2的工作流程和组件
!... # 摘要 本文综述了Proteome Discoverer 2.2软件的各个核心组件及其功能，详述了...实战演练章节则通过实验设计、数据处理优化和结果解读展示了软件在实际应用中的操作流程和科学发现。最后，本文探讨了故障排除与系
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本地Blast2GO安装，及其数据库更新和导入数据中断的解决方案
mengjiaoduan的博客
07-28 2224
http://blog.sciencenet.cn/blog-686680-748695.html http://blog.shenwei.me/local-blast2go-installation/
blast2go本地数据库安装和使用
mengjiaoduan的博客
07-28 5021
http://www.chenlianfu.com/?tag=blast2go
如何构建本地化的blast2go数据库
XIAOFEI@IDO
02-09 3260
1、blast2go数据库简介 这GO功能注释过程中，我们经常使用一些R包（ClusterProfiler），或者基于超几何检验的方法进行GO功能富集分析。这些分析多数情况下，是建立在具有参考物种信息的情况下。有时候，我们进行的数据分析，是建立在物种信息的情况下。比如，比较常见的无参转录组数据分析，或者发现新基因的时候。在这种情况下，我们常常通过序列相似性的方法，先找到相似的序列编号，再通过注释网站工具进行注释。 其中，blast2go是比较经典的一种blast算法。其基本步骤是，首先对需要注释的序列，与N
每日一生信--blast2go本地化(终极版)
mengjiaoduan的博客
07-28 1504
http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240101iy3d.html
应用MySQL数据库的实现本地BLAST及BLAST2GO
saghir的专栏
06-16 3696
原理：有了数据库以后，可以非常方便的把这些基因等信息调出来。简单高效的SQL语言让我们在海量数据中增删改查。Blast2GO® is an ALL in ONE tool for functional annotation of (novel) sequences and the analysis of annotation data。Gene Ontology, KEGG maps, Inter
mysql blast2go_blast2go本地化 mysql_study
weixin_32700139的博客
01-19 243
mysqlyum -y install mysqlmysqladmin -uroot -passwd "oebiotech"mysql -uroot -poebiotech 登录mysql1．修改MySQL的登录设置：# vi /etc/my.cnf在[mysqld]的段中加上一句：skip-grant-tables例如：[mysqld]datadir=/var/lib/mysqlsocket=/...
BLAST2GO
huangliangbo的专栏
09-24 3850
记得在2年前用过blast2go，非常好用的序列注释和分析工具。可是后来重新装了几次JAVA的新版本之后电脑里的blast2go就挂了。最近重新把JAVA1.6装了回来，忍不住又想到blast2go。打开熟悉的主页上，猛击此处：  接着按需要选择下载：  然后就是启动…………久违的界面出现了……   以下内容转自：http://hi.baidu.com/in
blast2go mysql_blast2go_blast2go中文使用说明_blast2GO
weixin_34554800的博客
01-20 1337
你可以选择在linux下或者windows下进行blast2go的架构，下面的教程适用于两种系统的安装。1.准备工作安装MySQL(请参考“MySQL-5.6.12.2下载与安装”)；下载并解压以下和文件(访问官网)：local_b2g_db.zip、b2g4pipe_v2.5.zip、gene_info.gz、gene2accession.gz、idmapping.tb.gz、go_201307...
conda 安装blast2GO
最新发布
09-27
要在Conda中安装Blast2GO，你可以按照以下步骤进行操作： 1. 首先，确保你已经安装了Conda。如果你还没有安装Conda，请访问https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/install/index.html以获取安装指南。 2. 打开终端或命令提示符，并激活你要安装Blast2GO的环境。你可以通过运行以下命令来激活环境： ``` conda activate <环境名> ``` 3. 接下来，使用conda命令安装Blast2GO。运行以下命令： ``` conda install -c bioconda blast2go ``` 这将从Bioconda渠道安装Blast2GO及其相关依赖项。 4. 安装完成后，你就可以使用Blast2GO了。运行以下命令来启动Blast2GO： ``` blast2go ``` 这将启动Blast2GO应用程序。
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