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RSS订阅转载 网页中嵌入flash文件的几种方法
1. object + embed 传统的方法优点：浏览器兼容性好，是 Macromedia 一直以来的官方方法缺点：a.embed 标签是不符合 W3C 的规范的，无法通过验证。当然，如果你不在乎什么规范不规范，另当别论。b.微软由于种种原因，在 sp2 后限制了 IE 的 ActiveX 的使用模式，就是在页面中的 ActiveX 有一个虚框，需要用户点击一次才能正
2017-01-24 11:54:14
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转载 Linux二级域名
Linux虚拟主机通过程序实现二级域名绑定到子目录 虚拟主机中CP控制台不支持将二级域名绑定到子目录的功能，用户可以通过程序实现将二级域名绑定到子目录。 有两种方法将二级域名绑定到子目录： 1. 配置.htaccess, 通过伪静态代码实现。具体实现方法参考：http://help.aliyun.com/knowledge_detail/6554929.html?spm=51
2017-01-20 18:13:31
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转载 快速搭建Web环境 Angularjs + Express3 + Bootstrap3
快速搭建Web环境 Angularjs + Express3 + Bootstrap3AngularJS体验式编程系列文章，将介绍如何用angularjs构建一个强大的web前端系统。angularjs是由Google团队开发的一款非常优秀web前端框架。在当前如此多的web框架下，angularjs能脱颖而出，从架构设计上就高人一等，双向数据绑定，依赖注入，指令，MVC，模板。Angular
2017-01-06 11:35:40
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转载 git提交到github
第一步：在本机上操作1、安装 Git 客户端如何安装不同操作系统的 Git 客户端，参见：http://help.github.com/win-set-up-git/2、打开 Git Bash，开始键入各种配置信息：git config --global user.name "You Name"git config --global user.email your
2016-12-11 18:37:12
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转载 Linux下安装Matlab2014及破解
文章已搬家至http://lanbing510.info/2014/12/03/Linux-Matlab.html最近由于项目需要，需要在ubuntu下安装Matlab，具体操作如下：1 从http://pan.baidu.com/s/1qYJ9tNm 下载Matlab2014的Linux版本及破解文件2 下载完成后将iso文件挂载到Linuxsudo mkdi
2016-10-02 11:16:49
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转载 HTML标签以及各个标签属性大全
HTML标签以及各个标签属性大全（网页制作必备） 总类（所有HTML文件都有的）--------------------------------------------------------------------------------文件类型 （放在档案的开头与结尾）文件主题 （必须放在「文头」区块内）文头 （描述性资料，像是「主题」
2016-07-10 11:25:37
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原创 R语言入门班
感谢： 吴明昊老师 Swirl包作者 《Elegant Graphics for Dataanlysis》书作者 《R Graphics Cookbook》书作者 第一课 R初体验(12 h)1、安装R2、安装RStudio3.在RStudio下输入以下命令：install.packages("swirl")安装Swirl4、调用Swir
2016-03-19 09:06:48
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转载 R语言apply函数族笔记
为什么用apply因为我是一个程序员，所以在最初学习R的时候，当成“又一门编程语言”来学习，但是怎么学都觉得别扭。现在我的看法倾向于，R不是一种通用型的编程语言，而是一种统计领域的软件工具。因此，不能用通用型编程的思维来设计R代码。在Andrew Lim关于R和Python的对比回答中，R是一种面向数组(array-oriented)的语法，它更像数学，方便科学家将数学公式转化为R代码
2016-03-17 13:11:11
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转载 Pydev无法导入新python模块的解决方案
问题：建立pydev工程后，import新安装的python模块时，eclipse预编译会报“unresolved import xxx”错误，而实际运行不会出错。这个问题虽然不会导致运行错误，但是却无法在代码中提示x模块中的任何类或方法。解决方法：进入Windows->Preferences->Pydev->Interpreter – Python菜单，转到Forced Builtins
2016-02-25 11:04:20
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转载 Python 正则表达式（模式匹配）
1． Python正则式的基本用法1.1基本规则1.2重复1.2.1最小匹配与精确匹配1.3前向界定与后向界定1.4组的基本知识2． re模块的基本函数2.1使用compile加速2.2 match和search2.3 finditer2.4 字符串的修改与替换3． 更深入的了解re的组与对象3.1编译后的Pattern对象3.2 组与Ma
2016-02-24 21:01:05
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原创 window系统LMAP(mysql+apache+php+wordpress)配置+web弹性托管+个人博客
欢迎访问我即将上线的个人博客www.758wang.com网址购买：要用whois查询准备购买的网站还有多久需要续费，新手要快最好不要cn后缀，win后缀的不知道可以用来做什么 https://help.aliyun.com/knowledge_detail/6563875.html边建网站边备案，9:00-18:00 阿里云客服 400-118-3456
2016-02-21 21:24:30
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原创 R语言实战笔记
部分源代码来自网络——如若侵犯了您的权益，请与我联系，我将立刻删除。《R语言实战》(Venables&Ripley(2000)Chambers(2008))总结：脑残地按一定格式调用函数,尽情蹂躏数据。1 R基础在R中，对象（object)是指可以赋值给变量的任何事物，包括常量、数据结构、函数，甚至图形。变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。 2 数据的准备可以使用r
2016-02-20 17:35:47
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原创 三分钟复习Shell脚本语言
http://c.biancheng.net/cpp/view/6994.htmlbash是 Bourne Again Shell 的缩写，是linux标准的默认shell ，它基于Bourne shell，吸收了C shell和Korn shell的一些特性。bash完全兼容sh，也就是说，用sh写的脚本可以不加修改的在bash中执行。因为Shell似乎是各UNIX系统之间通用的
2016-01-29 13:03:28
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转载 Python collections.defaultdict() 与 dict的使用和区别
在Python里面有一个模块collections，解释是数据类型容器模块。这里面有一个collections.defaultdict()经常被用到。主要说说这个东西。综述：这里的defaultdict(function_factory)构建的是一个类似dictionary的对象，其中keys的值，自行确定赋值，但是values的类型，是function_factory的类实例，而且具有默
2016-01-23 19:58:40
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转载 Python JSON模块
（一）什么是json：JSON(JavaScript Object Notation) 是一种轻量级的数据交换格式。易于人阅读和编写。同时也易于机器解析和生成。它基于JavaScript Programming Language, Standard ECMA-262 3rd Edition - December 1999的一个子集。JSON采用完全独立于语言的文本格式，但是也使用了类似于C语言
2016-01-14 14:12:06
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转载 为Eclipse安装Python开发插件
http://blog.csdn.net/chenlia/article/details/7043693 首先是安装eclipse,下载地址是点击打开链接,选一个合适的地方解压就可以用了. 第二步是下载python,下载地址是点击打开链接,安装,我安装在c:\python 第三步添加环境变量,和java差不多 第四步下载pydev
2016-01-02 21:00:00
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转载 有关 Python 2 和 Sublime Text 中文 Unicode 编码问题的分析与理解
有关 Python 2 和 Sublime Text 中文 Unicode 编码问题的分析与理解 Sylv问题背景：相信很多用 Sublime Text 来写 Python 2 的同学都遇到过以下这个问题（例如这位同学 /t/100435 和这位同学 /t/163012 ）：在 Sublime Text 里用 Cmd (Ctrl) + B 运行代码 pri
2015-12-24 20:21:27
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转载 #python+java#同样功能的代码两种语言实现
概述：设置两个数组/列表，列表a是[1,2,3]，列表b是['a','b','c']，把他们一对一对打印出来，但不打印“3：c”这对。python版：?123456789101112131415161718'''Created on 2014-11-2@author:
2015-10-25 16:50:29
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转载 JAVA crawler
最近在做一个从数据库下载生物信息的数据库，在基于OpenURL时，采用网络抓取的形式获取结果页，其中遇到这样的错误：Server returned HTTP response code: 403 for URL: http://www……………………而可以使用浏览器正确访问 因为服务器的安全设置不接受Java程序作为客户端访问因为服务器的安全设
2015-10-24 19:43:08
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转载 Python——列表，元组
一、简介 列表（list）是Python以及其他语言中最常用到的数据结构之一。Python使用使用中括号 [ ] 来解析列表。列表是可变的（mutable）——可以改变列表的内容。二、基本的列表操作 列表可以使用所有适用于序列的标准操作，例如索引、分片、连接和乘法。本文介绍一些可以改变列表的方法。 1. list 函数
2015-10-22 16:16:39
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转载 Django的安装和第一个工程的建立
Django的安装和建立工程详细步骤可以参考The Django book，里面讲的特别详细。我的安装过程如下：安装Django首先需要安装数据库，可选的数据库有好几种，我选择的是MySQL数据库，首先到MySQL官网上下载软件：http://www.mysql.com/安装后，还要下载MySQLdb软件：http://www.djangoproject.com/r/python-my
2015-10-21 11:35:25
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转载 R语言实战
人不能在同个地方栽两次跟头，那样的生活效率太低。所以我一直以来都保持着随手记录的习惯。现在把近半个月来遇到的关于R语言的错误分享一下，希望能帮助到一些朋友，同时也希望各位朋友把遇到的已解决的、未解决的错误提出来一下，完善彼此的知识点，谢谢！目录：连接数据库报错：negative length vectors are not allowed连接数据库报错：first argu
2015-10-12 12:49:48
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转载 SNPassoc全基因组关联分析
WGassociation(SNPassoc)WGassociation()所属R语言包：SNPassoc Whole genome association analysis 全基因组关联分析描述----------D
2015-10-08 23:42:20
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转载 Haploview做单倍型分析
自个数据用Haploview做单倍型分析 转载他人的 http://www.dxy.cn/bbs/topic/16025305Haploview http://www.broadinstitute.org/haploview/haploview-downloads第1步,制备基因型的文档,我用的是EXCEL,如图,从左至右依次为:pedigree/sample name,
2015-10-04 14:42:40
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翻译 Mastering Perl 总结提升
1章成为大师第2章高级正则表达式第3章安全编程技术第4章调试Perl程序第5章剖析Perl程序第6章Perl基础测试第7章清理Perl程序第8章符号表和typeglob第9章动态子程序第10章修改模块和临时调整模块第11章配置Perl程序第12章检查和汇报错误第13章日志第14章数据持久化第15章使用Pod第16章位操作第17章奇妙的
2015-06-22 00:00:17
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原创 Intermediate perl 总结提高
第一章简介第二章File::Spec 模块还提供了许多其它的方法来用可移植的方式处理路径。你可以通过perlport 文档了解更多有关移植方面的专题。grep 操作符取一个列表和一个"测试表达式". 它一个一个地从列表中把元素取出来放到$_ 变量中, 并在标量环境中, 用"测试表达式"来检验这个值.如果检验出来是个"真"值, grep 会把$_ 变量送到输出列表中。grep 中
2015-06-19 10:45:56
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翻译 胃癌的分子标记的整合的转录组和计算分析
Cui J, Chen Y, Chou W C, et al. An integrated transcriptomic and computational analysis for biomarker identification in gastric cancer[J]. Nucleic acids research, 2010: gkq960.材料：160份材料来自52分男性，25份
2015-06-19 08:34:35
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原创 肿瘤与癌症检测相关产品的生物信息分析
基本概念：泛指优一群生长失去正常调控的细胞形成的新生物（neoplasm)。肿瘤细胞是一个累积了不同基因突变的体细胞（这些突变共同导致了细胞增殖的失控，结果形成大量细胞的集合——肿瘤）。肿瘤遗传学是研究肿瘤与遗传关系以及肿瘤发病遗传机理的一门学科。某些遗传性缺陷或疾病具有肿瘤遗传易感性；染色体不稳定综合征的特征：易发生chr断裂和重排；具有AR、AD和XR的遗传特性；具有不同程度的易患肿瘤的倾
2015-06-16 17:36:46
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翻译 应用MySQL数据库的实现本地BLAST及BLAST2GO
原理：有了数据库以后，可以非常方便的把这些基因等信息调出来。简单高效的SQL语言让我们在海量数据中增删改查。Blast2GO® is an ALL in ONE tool for functional annotation of (novel) sequences and the analysis of annotation data。Gene Ontology, KEGG maps, Inter
2015-06-16 11:16:57
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翻译 基于参考注释的RNA-seq分析
Step 1 –构建参考序列索引：$ mkdirbti# 在stuXX目录下新建文件夹$ cd bti$ ln -s /database/peixun2015/ref/ath.fa# 在当前目录，建立参考序列文件的超链接$ bowtie2-build ath.faath# 为参考序列建立索引 Step 2 –比对基因组：$ mkdiralign # 在stuXX目录下新
2015-06-16 10:26:23
2555
原创 R语言——生物统计
首先回顾一些生物统计学关键词Coefficient of variability Standard deviation B(n,p) p(λ) N(μ,σ2) χ2分布 t分布 F分布 假设检验 单/双尾检验 F检验 T检验 χ2检验 方差分析 LSD SSR R语言与统计分析 第一章 R介绍第二章 R的基本原理与核心第三章 概率与分布第四章 探索性数据分析
2015-06-15 15:53:01
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翻译 Beginning Perl for Bioinformatics 总结提升
1 Biology and Computer Science2 Getting Started with Perl3 The Art of Programming4 Sequences and Strings5 Motifs and LoopsExample 53. Searching for motifs #!/usr/bin/perl w # Searching for mo
2015-06-15 00:01:50
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原创 NGS项目六：R语言与Bioconductor分析affymetrix芯片
6.1 数据输入与预处理从数据包CLL中载入芯片数据，完成预处理在bioConductor使用RMA算法预处理基因芯片原始数据。首先，去http://www.affymetrix.com/support/technical/sample_data/demo_data.affx下载一些示例数据文件下来。这里，使用Arabidopsis-AGAGCC数据示例。我们先把下载下来的文件解压后拷贝A
2015-06-10 22:57:03
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翻译 NGS项目五：用R语言生成极端嗜盐古菌蛋白序列进化树
基因表达数据分析和实验设计密不可分，总体来说，实验设计有两大类思路：一类是时间序列分析，主要思想是测定基因多个时间点的表达值，通过聚类和主成分分析等分析手段寻找调控基因，进而研究其深层机制；第二类是基因表达差异的限制性分析。 所谓GO注释，就是将表示基因或其产物的ID映射到一组GO的ID上，用这组GOterm来描述这个基因。而实际应用中，人们更关心一组基因（比如差异表达基因）的共
2015-06-08 09:25:31
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原创 NGS项目四：高通量测序在植物生物胁迫研究中的应用
在植物生物胁迫研究方面，本文通过作者所精密相关课题组的研究，比较传统研究方法和高通量测序方法的优劣。Sun X, Tan Q, Nie Z,et al. Differential Expression of Proteins in Response to MolybdenumDeficiency in Winter Wheat Leaves Under Low-Temperature
2015-06-07 09:48:56
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原创 NGS项目二：提高数据信息收集整合能力
高通量测序产生的庞大数据目前主要存储在三大数据库。普通事业单位、乃至个人需要使用vpn、ssh账户才能获得差强任意的获取速度。引用了两个链接介绍了如何一些合理使用互联网的方法。它们对Linux操作系统的掌握程度有一定要求。点击打开链接点击打开链接
2015-06-05 14:45:38
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转载 NGS项目一：RNA-Seq数据的Workflow
nature protocolDifferential gene and transcript expression analysis of RNA-seq experiments with TopHat and Cufflinks从原始的数据开始，进行reads回帖，到拼接转录本，计算表达量，分析差异表达，最后可视化分析结果。 TopHat是一个把reads回帖到基
2015-06-03 23:39:40
3456
转载 完全解读Linux环境变量
转载自：http://www.bkjia.com/xtzh/989223.html一、概述 环境变量：bash shell用一个称作“环境变量（environment variables）”的特性来存储有关shell会话和工作环境的信息，它允许你在内存中存储数据，以便运行在shell上的程序和脚本访问，这些数据可以用来识别用户、账户、系统、shell特性以及任何其他你需要
2015-06-02 18:18:34
586
XshellPortable
2015-08-03
空空如也
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