GROMACS-2025 CPU版本编译------以rockylinux8为例


GROMACS(GROningen MAchine for Chemical Simulations,格罗宁根化学模拟体系)是一套免费且开源的分子动力学模拟程序包,主要用来模拟研究蛋白质、脂质、核酸等生物分子的性质。
1、gromacs 2025需要高版本的比如gcc11及以上(rockylinux的8.5不行)、cmake-3.28以上;
2、​解压gromacs2025的源码包:tar -xvf gromacs-2025.0.tar.gz;
3、编译:CPU版本节点并行多线程,,cd gromacs-2025.0 && mkdir build && cmake …/ -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_GPU=OFF -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/software/gromacs-2025 && make -j,等待进度走完即完成编译;
cmake阶段
make阶段
make完成
make install 完成
加载gmx环境变量,gmx --version
4、enjoy !

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