OpenCL Kernel 结构不支持二级指针?

本文介绍了在使用OpenCL进行GPU并行计算时遇到的二级指针问题。博主在尝试用OpenCL解决字符串匹配问题时,发现OpenCL C不支持二级指针。为了解决这个问题,博主通过将二级指针转换为一级指针,并重新分配内存,最终实现了GPU上的匹配算法。虽然GPU执行速度达到CPU的1.5倍,但额外的转换步骤影响了效率,博主计划进一步优化算法。
摘要由CSDN通过智能技术生成

    最近在做一个关于用OpenCL来处理字符串匹配的小程序,

导师给出的题目是这样的,首先生成一个长度尽可能大的随机字符串(由ATCG这四个字符组成),然后设定1000个长度在2-10之间的随机字符串(也是由ATCG四个字符组成,然后将每个字符小字符串与大字符串去匹配,返回匹配项的下标值。

    由于笔者才疏学浅,所以刚开始用于测试的算法是自己写的最笨的穷举法:

由于要和cpu比较运行时间,所以在主程序中:

 

char* X=(char*)malloc(10000*seizeof(char));  //动态分配大字符串的空间

char**Y=(char**)malloc(1000*seizeof(clar*));//动态分配指向小字符串指针的空间

for(int i=0;i<1000;i++)

{

    Y[i]=(char*)malloc(11*seizeof(char));            //动态分配每个小字符串的空间

}

 

分配空间后,就给他们随机赋值,这里代码省略,

接下来就是匹配代码(返回匹配项代码省略):

 

void PipeiCPU(char **Y,char *X)

{

    int i=0;

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