Ubuntu17.10安装openmpi 2.0.4并识别Torque排队系统

本文档指导如何在Ubuntu 17.10上安装OpenMPI 2.0.4,并详细说明了将其配置为与Torque PBS并行计算排队系统协同工作的步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成

在安装完Torque之后(戳我),接下来需要安装可以进行并行计算的消息传递环境。我选择openmpi,并且需要将openmpi能够加入TorquePBS系统中排队作业。

1. 下载openmpi 2.0.4, 解压

tar -zxvf openmpi-2.0.4
cd openmpi-2.0.4

2. 预编译

sudo ./configure --prefix=<MPIDIR> --with-tm=<TORQDIR> CC=gcc CXX=g++ FC=<ifort全路径>/ifort
这里<MPIDIR>指openmpi的指定安装目录; --with-tm是让openmpi识别Torque系统。如果Torque在默认安装目录的话,官方文档表明不需要加这句话;但是如果Torque被安装在指定目录<TORQDIR>,那么需要在预编译的时候加上这句话。FC是指fortran编译器,这里我选择Intel Fortran编译器(经过我的测试别gfortran7.2版至少快一倍),所以要把ifort的绝对安装路径加上;同时,不需要再知名F77了,即使加上,openmpi2.0.4版本编译时也会显示跳过这一项的。

3. 安装

sudo make 
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