MIMICIV2.0版本Concepts自动生成

本文介绍了如何使用MIMIC-IV 2.0数据库官方提供的代码自动化生成Concepts,包括前期准备,从官网下载代码,配置PostgreSQL环境,以及在PostgreSQL中执行生成脚本的过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

近期MIMICIV数据库更新了2.0版本,较以往改了数据库结构,同时增加了出院后患者的死亡时间记录。MIMICIV的官方Github给了很多衍生表格的生成代码,以往我是要用的时候自己一条一条运行(手动生成法)。但最近想偷个懒,正好官方代码中有直接自动生成Concepts的代码。

前期准备

  1. MIMIC-IV2.0数据库安装,可参考我之前写的博客
  2. PostgreSQL的bin目录写到PATH中

第一步:上官网,下代码

Code
进入官网可以看到针对MIMICIV的更新,PostgreSQL的concepts代码也更新了。
在安装完数据库之后,找到postgreSQL代码的本地路径:mimic-code/mimic-iv/concepts/postgres/,可以看到里面有需要的代码:

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