近期MIMICIV数据库更新了2.0版本,较以往改了数据库结构,同时增加了出院后患者的死亡时间记录。MIMICIV的官方Github给了很多衍生表格的生成代码,以往我是要用的时候自己一条一条运行(手动生成法)。但最近想偷个懒,正好官方代码中有直接自动生成Concepts的代码。
前期准备
- MIMIC-IV2.0数据库安装,可参考我之前写的博客;
- PostgreSQL的bin目录写到PATH中
第一步:上官网,下代码
进入官网可以看到针对MIMICIV的更新,PostgreSQL的concepts代码也更新了。
在安装完数据库之后,找到postgreSQL代码的本地路径:mimic-code/mimic-iv/concepts/postgres/,可以看到里面有需要的代码: