医疗开发常用工具

Radiant Dicom Viewer

医学图像浏览器：Radiant 主要用来查看dicom影像。

ITK-Snap

ITK-Snap支持多种格式，二维三维图像都支持；可以方便的与原始图像或者其他处理结果进行对比。
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paraview

ParaView是一款开源、跨平台数据分析和可视化程序。
ParaView是对二维和三维数据进行分析和可视化的程序，它既是一个应用程序框架，也可以直接使用（Turn-Key）。
ParaView支持并行，可以运行于单处理器的工作站，也可以运行于分布式存储器的大型计算机。 ParaView用C++编写，基于VTK（Visualization ToolKit）开发，图形用户界面用Qt开发，开源、跨平台。
ParaView用户可以迅速的建立起可视化环境利用定量或者是定性的手段去分析数据。利用它的批量处理能力可以在三维或者是在报表中交互进行“数据挖掘”。
ParaView默认的提供了许多其他数据源接口和过滤，任何VTK过滤（filter）可以通过提供减慢的XML描述添加（VTK提供了上百个算法，可参考VTK文档）
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指南

3D Slicer 简介

（1）一个软件平台，用以图像分析（包括配准和实时编辑），图像可视化以及图像引导治疗。
（2）是一个免费、开源软件，并适用于Linux、MacOSX和windows操作系统。
（3）拥有强大的可扩展性，可以通过模块嵌入方式来增加新的功能和应用。
（4）3D slicer的主要特征有：适用于从头到脚的各个组织器官；兼容MRI、CT、US（超声）、核医学以及显微镜下的影像；拥有双向可交互性。还有更强大的数据分析和图像处理功能。
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临床影像实战
教程1 教程2

3D-DOCTOR

3D-DOCTOR是用于MRI，CT，PET，显微镜，科学和工业成像应用的高级3D建模，图像处理和测量软件。
3D-DOCTOR支持以DICOM，TIFF，Interfile，GIF，JPEG，PNG，BMP，PGM，MRC，RAW或其他图像文件格式存储灰度和彩色图像。3D-DOCTOR可在PC上实时从2D横截面图像创建3D表面模型和体积渲染。
可以将表面模型导出为STL（ASCII和二进制），DXF，IGES，3DS，OBJ，VRML，PLY，XYZ和其他格式，以进行外科手术计划，仿真，定量分析和快速成型应用。
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doctor3D
详细介绍

MIMICS

MIMICS是Materialise’s interactive medical image control system的缩写，是Materialise公司发明的一种医学影像控制系统，是模块化结构的软件，可以根据用户的不同需求有不同的搭配。
MIMICS是一套高度整合而且易用的3D图像生成及编辑处理软件，它能输入各种扫描的数据（CT、MRI），建立3D模型进行编辑，然后输出通用的CAD（计算机辅助设计）、FEA（有限元分析），RP（快速成型）格式，可以在PC机上进行大规模数据的转换处理。 MIMICS FEA模块MIMICS FEA模块可以将扫描输入的数据进行快速处理，输出相应的文件格式，用于FEA（有限元分析）及CFD（计算机模拟流体动力学），用户可用扫描数据建立3D模型，然后对表面进行网格划分以应用在FEA分析中。FEA模块中的网格重新划分功能对FEA的输入数据进行最大限度的优化，基于扫描数据的亨氏单位，可以对体网格进行材质分配。
基础模块
1 图像导入：支持大多数图像格式的导入，详情请参见软件主页。
2 图像分割：提供灰度阈值、区域生长、形态学操作、布尔操作、动态区域生长、多层编辑等分割工具。帮助用户快速方便地突出感兴趣区域。
3 图像可视化：提供原始数据的轴状、冠状和矢状试图；提供根据感兴趣区域重建得到的三维试图、并可以进行三维试图的平移，缩放和旋转。同时能够剪裁三维模型。
4 图像配准：提供图像配准、点配准和STL配准功能。
5 图像测量：点对点测量、轮廓线和灰度值测量、密度测量。
可选模块：快速成型（RP）切片模块、MedCAD模块、仿真模块、STL+模块
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Amira

Amira是澳大利亚Visage Imaging公司出品的一个功能强大的，多方面的工具软件，用于对数据进行可视化，操纵控制，2012年7月31日VSG公司宣布收购Amira，VSG旗下还拥有open inventor和Avizo.
Amira能够识别生命科学和生物医学的数据的来源以及类型、方式，这些类型包括：光学和电子显微镜、CT，MR，PET，SPECT，超声波、工程和表面建模工具、蛋白数据库和分子模拟，以及各种物理测量和模拟。
当多维数据需要加以可视化并进行探索的时候，Amira提供了一个极其丰富的一套功能强大的工具与一个直观和易于使用的图形用户界面。
Amira软件中所提供的先进的可视化技术，让你对数据获得详细的了解。自动和交互式分割和建模工具，支持灵活创造的三维表面和有限元模型为最优的可视化和模拟。现代图形硬件被有效的利用来显示大型数据集，在互动速度与图像质量方面都无与伦比。Amira的三维渲染功能强大,无论是用于三维数据研究还是演示都能获得优秀的效果。
主要功能
处理和重构：通过各种数字过滤器及交互式编辑器来处理图像；对图像体内的组织和区域进行重构。
可视化和探索：拥有快速交互式及高质量的可视化技术，您可以轻易的通过裁剪和配色来探索体数据。
分析和量化：利用高级的统计工具对体进行面和网格分析；交互的完成对距离、角度、面和体的几何测量；Amira同MATLAB相结合，执行模拟和先进的数字分析功能。
展示和教学：创建高质量的基于事件时间轴的交互式立体或非立体演示，并生成动画或视频演示文件。
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Osirix

OsiriX是一款医疗图像处理软件，用于医疗方面，操作简单，可以把CT（计算机断层扫描）和MRI（核磁共振）的数据加以整合而生成3D的图像，可以旋转，透视甚至是动画等各种操作。只支持苹果操作系统。
主要的功能包括：2D查看器;3D处理;图像优化;支持DICOM文件;支持DICOM网络支持非DICOM文件;扩展和科学研究;基于开源的模块;能生成DICOM CD-Roms。
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