一种全新的鉴别植物性膳食补充剂中PDE-5抑制剂及其衍生物的方法

摘要:本文设计了一种全新的鉴别植物性膳食补充剂中PDE-5抑制剂及其衍生物的方法。首先设计出一系列的PDE-5抑制剂类似物,通过DS中的libdock进行对接,挑选出打分较好的结果,再通过SPR实验方法验证DS预测的结果,第二步通过DFT再次进行预测,并通过SERS方法对DFT预测的结果进行验证,通过两步预测两步验证的方法构建了鉴别模型,对植物性膳食补充剂中的PDE-5抑制剂类似物进行鉴别。结果证实鉴别方法结果可靠,为鉴别没有标准品的PDE-5抑制剂类似物提供了解决方案。

子对接(molecular docking是基于结构药物设计的核心模拟手段,依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程,模拟受体-配体相互作用,预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术,科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选,药物分子的结构改造,药靶相互作用的机理研究等工作,从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中,共有四种对接程序,包含LibdockCDOCKERFlexibleDocking,这三种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为其提供配体受体间相互识别的“利器”。

一种全新的鉴别植物性膳食补充剂中PDE-5抑制剂及其衍生物的方法 

refAnalytical ChemistryIF=6.35

链接:10.1021/acs.analchem.8b01609

西地那非是一种PDE-5的抑制剂,用于治疗男性勃起障碍的药物。西地那非如果与硝化甘油,多沙唑嗪,特拉唑嗪一起使用会引起强烈的副作用。植物性膳食补充剂因其安全,无副作用而备受关注,然后很多补充剂中却人为添加一些PDE-5抑制剂的类似物,对人体健康造成很大的危害,由于很多类似物没有标准品,对检验带来困难。本文设计了一种全新的鉴别植物性膳食补充剂中PDE-5抑制剂及其衍生物的方法。首先设计出一系列的PDE-5抑制剂类似物,通过DS中的libdock进行对接,挑选出打分较好的结果,再通过SPR实验方法验证DS预测的结果,第二步通过DFT再次进行预测,并通过SERS方法对DFT预测的结果进行验证,通过两步预测两步验证的方法构建了鉴别模型,对植物性膳食补充剂中的PDE-5抑制剂类似物进行鉴别。结果证实鉴别方法结果可靠,为鉴别没有标准品的PDE-5抑制剂类似物提供了解决方案。

 

图一 设计出的西地那非衍生物。

 

图二 西地那非,S-102与PDE-5对接结果。

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