钾离子通过大电导Ca~(2+)激活钾通道的渗透机理的研究

摘要：在本研究中，通过化学计算和数据挖掘的方法研究了K+在SF中的渗透模式，该模式是基于Aplysia Californica的Slo1分子结构进行的。使用Discovery Studio软件研究了SF内部的键构型和K+s的自由能。结果表明，为了适应不断增加的能级和容忍更多的K+s，SF的4倍对称亚基只能在垂直于中心轴的一个方向上移动。此外，通常采用K+s与SF之间的两种化学键构型，包括低自由能下的螯合构型和高自由能条件下的复杂构型。此外，SF内多个K+s的键构型的三种模式被用来适应SF的能量变化，并且每个模式由一个或两个亚构象组成。这些发现可能源于Slo1蛋白功能的进化优化。SL1通道的比电导和电压选通可以用当前研究中发现的K+s渗透机制重新解释。K+s通过SF的渗透机制可用于了解各种毒素与Slo1通道之间的相互作用，并可用于开发针对相关离子通道的新药。

分子对接（molecular docking）是基于结构药物设计的核心模拟手段，依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程，模拟受体-配体相互作用，预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术，科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选，药物分子的结构改造，药靶相互作用的机理研究等工作，从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中，共有四种对接程序，包含Libdock、CDOCKER、FlexibleDocking，这三种对接算法各有优势，能够满足广大科研工作者的多种应用需求，为其提供配体受体间相互识别的“利器”。

钾离子通过大电导Ca~(2+)激活钾通道的渗透机理的研究 

ref：ACS Chem. Neurosci；IF=3.861

链接：10.1021/acschemneuro.9b00215

钾离子(K+)通过大电导Ca~(2+)激活的钾(SL1)通道的选择性过滤器(SF)的渗透仍然是一个值得研究的有趣问题。虽然K+进入和离开SF的模式已经被揭示，但是K+通过SF的机制仍然不清楚。在本研究中，通过化学计算和数据挖掘的方法研究了K+在SF中的渗透模式，该模式是基于Aplysia Californica的Slo1分子结构进行的。使用Discovery Studio软件研究了SF内部的键构型和K+s的自由能。结果表明，为了适应不断增加的能级和容忍更多的K+s，SF的4倍对称亚基只能在垂直于中心轴的一个方向上移动。此外，通常采用K+s与SF之间的两种化学键构型，包括低自由能下的螯合构型和高自由能条件下的复杂构型。此外，SF内多个K+s的键构型的三种模式被用来适应SF的能量变化，并且每个模式由一个或两个亚构象组成。这些发现可能源于Slo1蛋白功能的进化优化。SL1通道的比电导和电压选通可以用当前研究中发现的K+s渗透机制重新解释。K+s通过SF的渗透机制可用于了解各种毒素与Slo1通道之间的相互作用，并可用于开发针对相关离子通道的新药。

 

图一 钾离子通道的结构类型。

 

图二 钾离子与钾离子通道稳定结合的两种模式。

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