采用standard-precip计算SPEI

文章介绍了如何在Python环境下安装并使用standard-precip库进行站点SPEI(StandardizedPrecipitationEvapotranspirationIndex)计算,处理缺失值以及数据导出的过程。作者提到在遇到环境问题导致安装失败时,分享了部分代码片段以处理数据和确保计算的进行。
摘要由CSDN通过智能技术生成

standard-precip包的安装可以上github搜索并安装。安装方法为conda中输入。

pip install standard-precip

该库包在安装时可能由于python配置的环境问题安装失败,但我没有找到解决措施(在另一台电脑中安装失败)

import pandas as pd
import os
from standard_precip import spi
import math

导入需要用到的库包

i = 568
while i<=16919:
    data_1 = pd.read_csv("G:/Python_/mid_7/point_data/"+str(i)+".csv")

写入while循环,这样就能对文件夹下每个站点的SPEI作计算。i代表我的数据站点名称,一直到16919.csv。

    if math.isnan(data_1.loc[1,'rain']) == True:
        i += 1
        continue

这一步的原因是该库包不允许出现空值,但我的降雨数据有缺失,所以采用math.isnan进行查找,如果该站点有空值,直接跳过到下一个站点。如果没有空值则不需要这一步。

    data_1['rain-pet'] = data_1['rain'] - data_1['PET']

这一步开始计算,根据spei的原理先计算出降雨与蒸散的差值,‘rain’和‘PET’要看文件里具体对应的名称。

    spei_calculator = spi.SPI()
    spei_monthly = spei_calculator.calculate(data_1, 'time', 'rain-pet', freq='M', scale=1, 
                                              fit_type="mle", dist_type='glo')
    print(str(i)+"!!!")

data_1是数据,‘time’是时间,需要根据文件里对应的列名确定;'rain-pet'就是降雨与蒸散的差值,根据自己的命名而定;freq=‘M’代表数据是以月进行的,还可以有周和年,具体看库包的base-sp介绍(按住ctrl再点一下standard-precip);scale=1,结合前面的‘M’代表以一个月为尺度计算,三个月即为3,年尺度则为12; dist_type代表拟合类型,SPEI可选择Generalised Logistic,对应的代码为‘glo’,该拟合方式的fit_type只能是‘mle’。如何确定采用哪种拟合方式可参考github中的介绍,应该有一个pdf文件具体忘记叫什么了。

spi计算也可参考以上步骤,更改拟合方式和数据即可

    out_path = os.path.join("G:/Python_/mid_7/sewdi/"+str(i)+".csv")
    spei_monthly.to_csv(out_path)
    i += 1

导出数据并进行下一循环

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