在ensembleplants上下载到如下序列
格式化最终样式如下:
具体需求是提取出基因名字并且将序列内部的换行符删除掉,之前都是用一些工具或者python循环处理的方法来做,今天试了一下sed,发现有很多问题。
首先使用sed命令将>后边的内容只保留基因名
cat Triticum_aestivum.IWGSC.pep.all.fa |sed
在ensembleplants上下载到如下序列
格式化最终样式如下:
具体需求是提取出基因名字并且将序列内部的换行符删除掉,之前都是用一些工具或者python循环处理的方法来做,今天试了一下sed,发现有很多问题。
首先使用sed命令将>后边的内容只保留基因名
cat Triticum_aestivum.IWGSC.pep.all.fa |sed