工作内容Rshiny框架使用

shiny Server学习记录-网络计算

• http://218.94.144.229:8098/NetworkEntropy/ 用户名 admin 密码 123qwe

• shiny api文档http://shiny.rstudio.com/reference/shiny/latest/

• shiny github https://github.com/rstudio/shiny

• Shiny Server配置 https://blog.csdn.net/wendaomudong_l2d4/article/details/75105440

• R shiny基础教程 https://blog.csdn.net/u014801157/article/category/5690387

• windows下无法正常安装某个类库时,Windows 下R软件如何安装GO.db程序包https://blog.csdn.net/hhl_csdn/article/details/51933673?tdsourcetag=s_pctim_aiomsg

• 内网是在浏览器下输入 http://:3838/APP_NAME/即可

一些重要的命令

先复制shiny包自带样例到目录下

cp -r /usr/lib64/R/library/shiny/examples/* /srv/shiny-server/   

shiny server 服务设置状态

#查看状态
sudo systemctl status shiny-server
#开启
sudo systemctl start shiny-server
#停止
sudo systemctl stop shiny-server
#重启
sudo systemctl restart shiny-server

1. 配置文件位置：/etc/shiny-server/shiny-server.conf
2. 报错时查看日志[服务器运行日志]
   /var/log/shiny-server.log
3. shiny运行日志[类似R的运行日志]
   /var/log/shiny-server

当无法安装某些包时可使用下面的代码进行安装：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("包名")

R 3.3.3 R语言执行需要安装的程序包

以管理员权限运行Rgui,并指定包安装的位置，防止安装到其他目录

.libPaths("C:/Program Files/R/R-3.3.3/library")

install.packages('pillar')

install.packages("ClustOfVar")
install.packages("psych")
install.packages("GPArotation")
install.packages("stringr")
install.packages("readxl")
install.packages("ca")
## 这个包可能也不正常
install.packages("arulesViz")


## 这些包无法正常安装
install.packages("arules") 
install.packages("lavaan")

中医网络分析模块

    biocLite('GO.db')
    biocLite('org.Hs.eg.db')
    biocLite('clusterProfiler')

    biocLite('WGCNA')

    intsall.packages('WGCNA')

2018-12-26
可以不阻塞当前运行的程序

• shiny 异步 编程 https://rstudio.github.io/promises/articles/intro.html