自定义博客皮肤VIP专享

*博客头图:

格式为PNG、JPG,宽度*高度大于1920*100像素,不超过2MB,主视觉建议放在右侧,请参照线上博客头图

请上传大于1920*100像素的图片!

博客底图:

图片格式为PNG、JPG,不超过1MB,可上下左右平铺至整个背景

栏目图:

图片格式为PNG、JPG,图片宽度*高度为300*38像素,不超过0.5MB

主标题颜色:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

Hover:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

副标题颜色:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

自定义博客皮肤

-+
  • 博客(6)
  • 资源 (3)
  • 收藏
  • 关注

原创 ISMRM2015定量评估记录

提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档文章目录前言 一、pandas是什么? 二、使用步骤 1.引入库 2.读入数据 总结前言目前还是不确定2015挑战赛的评估代码是不是就是tractometer的代码一、code下载根据github上的步骤进行安装,每一步都尽量去做,不要跳(血泪教训。1.升级pippip install -U pip2.安装依赖!!!一定要使用python=2.7!!!!addit...

2022-05-20 21:08:23 301

原创 Ubuntu安装singularity报错记录

需要用singularity执行nextflow命令

2022-05-18 16:54:20 3245 4

原创 theano-GPU运行时pygpu.gpuarray.GpuArrayException: b‘cuMemAlloc: CUDA_ERROR_OUT_OF_MEMORY: out of memory

项目场景:l2t代码需要使用theano库和gpu加速计算非root用户 ubuntu-18.04+cuda8.0(需要把gcc降级为相匹配的左右,我配为5.3)+cuDnn v5.1+theano 1.0.4+pygpu 0.7.6问题描述pygpu.gpuarray.GpuArrayException: b'cuMemAlloc: CUDA_ERROR_OUT_OF_MEMORY: out of memoryTraining... 2448.24 sec.Traceback

2022-04-23 13:12:57 2603

原创 conda安装dipy包

提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档安装一、正确步骤 二、错误记录提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考一、步骤从dipy官网上寻找下载语句,然后conda和pip install换着来,不行的话可能是网站或什么服务器的原因,过段时间再装二、错误记录1.引入库代码如下(示例):import numpy as npimport pandas as pdimport matplotlib.pyplot as pltim.

2022-04-19 09:34:10 761

原创 EOFError: Compressed file ended before theend-of-stream marker was reached

WARNING (theano. tensor.blas): using NumPy C-API based impLementation for BLAS functions.Loading DWIs... 4.44 sec.Traceback (most recent call last):File "track.py", Line 1100, in <moduLe>main()File "track.py", line 814,inweightsneurotools . r.

2022-03-23 22:56:03 1081 1

原创 freesurfer使用

一.做灰白质分割我的目的是得到某被试的脑白质mask。1.首先找了freesurfer教程,直接打开了freeview;2.可视界面中没有直接的wmseg功能;3.去使用freeview的手册查询wmseg(开始怀疑这种操作不叫该名词..),查了手册看不懂;4.找视频教程先google英文看不懂,转b站没找到合适标题的。后师兄推荐了一节课是recon-all的。发现此操作得到的结果中有wm.mgz5.对比已有白质模板数据,分割应该是对的,6.需要将其由grayscale转为bin

2022-03-13 17:31:28 1317

2015挑战赛---评估代码

2015挑战赛---评估代码

2022-05-21

2015挑战赛评估代码---tractconvert

2015挑战赛评估代码

2022-05-21

ISMRM2015 scoring_data

ISMRM2015 scoring_data

2022-05-20

空空如也

TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹

TA关注的人

提示
确定要删除当前文章?
取消 删除