推荐书籍:RNA甲基化表观转录组学

浙江大学出版社印刷出版了北京基因组研究所(国家生物信息中心)合作著作的生命科学著作《RNA 甲基化表观转录组学》,该著作入选“中国基础研究前沿”丛书。

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  表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰,基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来基于DNA和蛋白质修饰,可逆RNA甲基化修饰研究引领第三次表观遗传学修饰研究浪潮。RNA存在150余种化学修饰,甲基化是最主要的修饰形式,鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技术,是揭示RNA化学修饰调控基因表达和功能规律的基础。鉴于RNA甲基化表观转录组学研究迅速发展态势,急需系统性梳理该领域的原创性科学发展。

  本书总结了北京基因组研究所(国家生物信息中心)杨运桂研究团队与合作者及国内外同行在RNA甲基化修饰及表观转录组学研究中取得的重要前沿进展,内容涵盖了RNA甲基化修饰的去甲基化酶、甲基转移酶和结合蛋白等RNA 修饰相关酶的发现过程,以及甲基化修饰调控RNA加工代谢及正常生理和异常病理等重要生命活动的机制研究。这些成果证明,RNA 甲基化修饰类似于DNA 甲基化,具有动态可逆性,拓展了RNA 修饰与表观转录组学研究的新领域,完善了中心法则表观遗传学规律,进一步拓展了基因表达调控的外延。书中还就目前RNA 修饰研究的总体状况进行了分析和总结,就RNA 修饰研究领域面临的机遇和挑战进行了展望。

  本书作者之一、RNA甲基化研究领域的突出贡献者芝加哥大学何川教授为本书撰写了序言,并在其中指出:“本书的出版,对读者全面、深入了解RNA 修饰与表观转录组学大有裨益,对推动表观转录组学的未来发展也将发挥不可忽视的作用。”

  本书的研究成果得到了国家自然科学基金委员会、科技部、中国科学院等基金资助。本书得到了国家自然科学基金委员会 “ 中国基础研究前沿”丛书和国家科学技术学术著作出版基金资助出版。

王秀杰;刘峰;孙莹璞;李伟;杨运桂;何川;汪海林;周琪;周芳坚;种康;袁增强;黄牛;黄旲;麻锦彪;谢丹;RNA甲基化表观转录组学,浙江大学出版社,306千字,2021年2月(著者名单姓氏笔画为序)

目录:

第1章  RNA去甲基化酶
 1.1  FTO:第一个RNA m6A去甲基化酶
1.2  FTO参与mRNA选择性剪接并调控脂肪前体细胞分化
 1.3  ALKBH5:第二个RNA m6A去甲基化酶
1.4  国内外研究进展
参考文献

第2章  RNA甲基转移酶
2.1  WTAP是RNA甲基转移酶复合物的调控亚基
2.2  RNA m6A甲基化修饰生成受miRNA调控并促进千细胞重编程
2.3  NSUN2催化mRNA上m5C的形成
2.4  国内外研究进展
参考文献

第3章
RNA甲基结合蛋白
3.1  细胞核m6A结合蛋白YTHDC1参与调控前体mRNA选择性剪接
3.2  细胞质m6A结合蛋白YTHDF3促进mRNA翻译
3.3  细胞核内的m5C结合蛋白ALYREF调控mRNA出核运输
3.4  RNA m5C修饰结合蛋白YBX1调控膀胱癌增殖和转移
3.5  国内外研究进展
参考文献

第4章  RNA甲基修饰调控造血干细胞定向分化
4.1  m6A调控斑马鱼胚胎造血千细胞分化
4.2  m6A调控小鼠胚胎造血干细胞分化
4.3  国内外研究进展
参考文献

第5章  RNA甲基化修饰调控精子发生
5.1  ALKBH5介导的m6A调控小鼠精子发生
5.2  METTL3介导的m6A修饰调控精原千细胞分化和减数分裂起始过程
5.3  国内外研究进展
参考文献

第6章  RNA甲基化修饰调控发育
6.1  RNA甲基化修饰在中枢神经系统发育中的功能
6.2  m6A结合蛋白PRRC2A调控少突胶质细胞的特化
6.3  RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制
6.4  国内外研究进展
参考文献

第7章  RNA甲基化修饰调控水稻高温适应性
 7.1  OsNSUN2作为水稻mRNA m5C甲基转移酶
 7.2  osnsun2突变体中光合系统发生缺陷
 7.3  mRNA m5C促进蛋白翻译效率
 7.4  国内外研究进展
 参考文献

第8章  FTO化学抑制剂恩他卡朋介导代谢调控
 8.1  结构虚拟筛选方法鉴定FTO潜在化学抑制剂一恩他卡朋
 8.2  恩他卡朋通过抑制FTO影响FOXO1表达调控糖脂代谢
 8.3  国内外研究进展
 参考文献

第9章  RNA甲基化前沿研究展望
 9.1  其他RNA修饰
 9.2  展望

参考文献
索引

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