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C语言
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C/C++传递二维数组[转载]
#include void func(int n, char str[][5]){ int i; for (i = 0; i void func(int n, char (*str)[5]){ int i; for (i = 0; i转载 2010-06-04 15:21:00 · 395 阅读 · 0 评论 -
“不务正业”的化学奖又发给了生物
斯德哥尔摩时间10月3日11时45分(北京时间10月3日17时45分),2018年诺贝尔化学奖揭晓。Frances H. Arnoid因研究酶的定向功能改造而分享一半奖金;George P. Smith 和Sir Gregory P. Winter****噬菌体展示技术基于的抗体改进而共享另一半奖金。从1901年至2018年的诺贝尔化学奖历年获奖数据概览见下图所示,绘制方法见:networ...原创 2018-10-25 11:12:55 · 434 阅读 · 0 评论 -
bash 字符串处理
欢迎关注微信公众号生信宝典:https://mp.weixin.qq.com/s/lWNp_6W_jLiogmtlk9nO2A 本篇是我最开始学习Linux命令时看的一篇帖子,最早见于ChinaUnix (这次查找其出处时发现2002年就有这篇)。学习过程中,转载到我的博客,遇到问题就查一下。这次看到,把格式整理了,部分内容做了校对,增加了解释和示例,分享于此,也是对之前16篇Linux入门和生物原创 2017-12-26 16:52:59 · 778 阅读 · 0 评论 -
程序员小抄 (转载自酷壳,一个专注技术的博客)
你是否会经常忘记一些CSS中的函数名或是一些属性名,那个时候,你一定觉得,如果手边有一个“小抄”(Cheat Sheet)就好了。当然,这个“小抄”不是给你作弊用的,这个“小纸条”就是可以让你马上知道那个你最想知道的东西。这个“小抄”上也不需要有所有的东西,就需要那些经常用的就行了。现在,网上有很多这样的“小抄”,它们可能是PDF格式的,可能是PNG格式的,你可以很方便地把其打印出来(可以打印得很转载 2017-12-12 15:58:43 · 707 阅读 · 0 评论 -
基于人工智能的文献检索,导师查找,更聪明
欢迎关注公众号生信宝典:http://blog.genesino.com/2017/11/semanticscholar/上次推出的GeenMedical:文献查询、筛选、引用排序、相似文献、全文下载、杂志分区、影响因子、结果导出、杂志评述、直接投稿,一站服务文章讲述了文献检索的良器。这次再推荐另一个良器,在一定程度上存在功能重叠,又有互补。特有的基于人工智能的文章施引影响力和作者分析是亮点。Sem原创 2017-11-14 17:40:17 · 5142 阅读 · 0 评论 -
好色之旅-画图三字经
欢迎关注公众微信号生信宝典:https://mp.weixin.qq.com/s/bsvB1k17Izom2ldgdwXrdg 艺术家好色,科学家也好色娱乐圈好色,科研圈也好色老板好色,学生也好色一张漂亮的图,吸引了无数的回头客问曰:怎么获得美图呢?答曰:找海哥啊!傻瓜系列, 实力主创APP,皆精通AI, PPT, PS烽火长城,印记重编程皆出自其同门然而手工绘,要求高一要软件熟,二要素养好但若我原创 2017-11-17 15:43:31 · 556 阅读 · 0 评论 -
GSEA富集分析 - 界面操作
欢迎关注微信公众号生信宝典:http://mp.weixin.qq.com/s/3Nd3urhfRGkw-F0LGZrlZQGSEA定义Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的贡献。其输入数据包含两部分,一是已知功能的基因集 (可以是GO注释、MsigDB的注释或其它符合格原创 2017-11-17 15:30:47 · 38936 阅读 · 2 评论 -
Survival analysis
欢迎关注博客:http://blog.genesino.com/2017/08/Survival-analysis-plots/准备工作#安装R包#install.packages(c("survival", "survminer"))#加载R包library(survival) library(survminer) #survival包里包含的数据集data(package="surv原创 2017-11-08 15:59:54 · 2613 阅读 · 0 评论 -
文章用图的修改和排版(2)
欢迎关注生信宝典:https://mp.weixin.qq.com/s/HTsufk71U3wf14OOWSKEeQ 教师节时, 我们推出了文章用图的修改和排版视频教程, 演示了如何利用Adobe Illustrator修改分析获得的矢量图和实验获得的标量图; 并整理了一系列的视频教程在 生信宝典视频教程R TCGA Cytoscape。在录制那期视频时, 翻阅了之前准备文章期间做的图形排版教程。原创 2017-11-07 15:45:50 · 724 阅读 · 0 评论 -
MPI安装脚本
#!/bin/bashset -xwget urltar zxvf ~/mpich2*cd ~/mpich2*./configure --prefix=/usr/local/mpich2 --enable-sharedlibs=gcc nake#make 2>&1 | tee m.txtsudo make install#/usr/local/bin/sbin/mpeuninstall may be used to remove the installationech原创 2010-06-05 20:48:00 · 1154 阅读 · 1 评论 -
一个可用的MakeFile模板[综合别人的经验]
cc=gccCFLAGS= -g -Wall LINK=-lmLIBS=-I/home/ct/clibOBJECTS = ct_main.oSOURCES = ct_main.c.c.o: $(cc) $(CFLAGS) -c -o $@ $ $@.$$$$; / sed 's,/($*/)/.o[ :]*,/1.o $@ : ,g' $@; / rm -f $@.$$$$ include $(SOURCES:.c=.d)main:$(OBJECTS) $(原创 2010-06-05 14:01:00 · 598 阅读 · 0 评论 -
并行计算部分总结
1。计算机的峰值为主频x4。2。计算机读取数组时,一次会读入一行,要最大限度的利用已读入的数据,减少频繁读写的次数。3。多线程内存共享,多进程需要消息传递来交换变量。4。利用管道在不同程序之间传递内容(可以是管道符|或mkfifo mypipe)5。平均不同节点的计算量,尽量做到负载平衡。6。数据分块是每块大小尽可能为cache的1/3。7。MPI_CHAR 为一个字符,但不一定是一个字节。8。在MPI_Init()之后再处理命令行参数。9。MPI_Recive()出现在MP原创 2010-06-05 17:48:00 · 4775 阅读 · 0 评论 -
Excel改变了你的基因名,30% 相关Nature文章受影响,NCBI也受波及
EXCEL是常用的查看表格的工具,提供了很好的数据筛选、绘图等功能,不少基因表达数据也会在EXCEL中打开查看、筛选和排序。还有 3 个超赞的 EXCEL 插件,让你 5 分钟从小白变大神。但是EXCEL也会出现比较尴尬的事情,如基因名字的转换。比如gene symbols SEPT2 (Septin 2)、MARCH1 [Membrane-Associated Ring Finger (C3H...原创 2018-10-25 11:19:22 · 1071 阅读 · 0 评论