JGG｜袁慧军/陈润生/刘默芳团队综述遗传性疾病非编码区变异致病机制研究进展...

既往对遗传性疾病致病基因的鉴定和机制解析主要集中在蛋白质编码区变异上，对占据人类基因组97%以上的非编码区域变异致病性研究甚少。人类基因组非编码区变异可以影响基因表达、调控和染色质构象，与遗传性疾病的发生发展有密切关系。了解非编码变异与疾病之间的功能联系是医学遗传学领域极具挑战的研究方向，也是临床遗传学家和临床医生面临的研究难题。随着高通量测序技术和功能基因组学工具不断发展，系统鉴定功能性非编码区变异成为可能。

2024年1月4日，Journal of Genetics and Genomics在线发表四川大学华西医院罕见病研究院袁慧军教授团队、中国科学院生物物理研究所陈润生院士团队和中国科学院分子细胞科学卓越创新中心刘默芳教授团队合作题为“Exploring noncoding variants in genetic diseases: from detection to functional insights”的综述论文。该综述系统总结了人类基因组非编码区变异对于遗传性疾病发生发展的影响，梳理了当前人类基因组非编码区变异研究领域的关键问题和面临的挑战，并对未来非编码区变异研究的发展方向进行深度讨论。

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该综述全面概述了遗传性疾病中非编码变异的种类以及生物学功能，主要涉及非编码变异的鉴定和功能表征；系统梳理了当前用于鉴定非编码变异的主要策略；介绍了用于解析非编码变异机制的模式系统，并对非编码变异鉴定和表征的最新研究手段进行了总结。最后，该综述深入讨论了未来非编码变异的关键研究方向，这些方向主要集中在开发先进高通量测序及功能鉴定技术，构建可靠生物信息学算法和实验验证模型，以及整合单细胞和空间多组学资源，借助大数据、大模型和人工智能推动数据的深度融合。该综述指出，深入研究遗传性疾病非编码区致病突变是提高临床遗传诊断率的有效途径，而解析遗传疾病中非编码变异的致病机制对于开发精确诊疗和个性化医疗策略至关重要。随着研究不断推进，有可能形成非编码变异相关的新理论体系。

遗传性疾病非编码区变异鉴定及功能机制解析的总体研究思路

作者简介

四川大学华西医院巫轲博士为该论文第一作者，袁慧军教授、中国科学院生物物理研究所陈润生院士和中国科学院分子细胞科学卓越创新中心刘默芳教授为该论文共同通讯作者。相关工作得到国家自然科学基金重点项目、四川大学华西医院学科卓越发展1·3·5工程项目和四川省重点研发项目资助。

引用本文

Ke Wu, Fengxiao Bu, Yang Wu, Gen Zhang, Xin Wang, Shunmin He, Mo-Fang Liu, Runsheng Chen, Huijun Yuan. (2024). Exploring noncoding variants in genetic diseases: from detection to functional insights. Journal of Genetics and Genomics.

DOI：10.1016/j.jgg.2024.01.001

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