卡方检验从csv文件中筛选出5000个特征

最新推荐文章于 2022-03-09 09:23:15 发布

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分类专栏：数据处理文章标签： python csv

本文链接：https://blog.csdn.net/qeqjkqjklq/article/details/112850959

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 皮尔逊的卡方检验（拟合度） 不适用于负值。这是合乎逻辑的，因为卡方检验假定频率分布，频率不能是负数。所以， sklearn.feature_selection.chi2 断言输入是非负的。
 所以要用归一化处理

# 1、先用筛选出来的特征直接放进去试试
# # 2、

import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
from sklearn import preprocessing

file=open('C:/Users/Administrator/Desktop/乳腺癌数据/new/brca_rna_SF.csv','w', newline='')

TCGAEx_cnv = pd.read_csv("C:/Users/Administrator/Desktop/乳腺癌数据/brca_rna_subtype.csv"