dicom worklist、pacs环境搭建

dcmtk的安装和使用

OFFIS DICOM 工具包 官网：dicom.offis.de - DICOM Software made by OFFIS - DCMTK - DICOM Toolkit

windows版本下载地址：https://dicom.offis.de/download/dcmtk/dcmtk366/bin/dcmtk-3.6.6-win64-dynamic.zip

部分工具包使用方法记录

wlmscpfs .exe

启动worklist管理的SCP服务工具🔗

相关命令：

wlmscpfs.exe -d -dfr -dfp wlistdb 104

-d 可以查看一些输出信息
-dfr 表示接受字段不完整的 DICOM 文件作为查询内容；
-dfp wlistdb 表明 wlmscpfs.exe 搜索的文件夹的路径，可以为绝对路径；
104  为工作列表程序的端口号；
wlistdb 文件夹下的 OFFIS 表示 AETITLE （AETITLE作为文件夹命名，文件夹下存放查询的wl文件，在该目录下新建一个lockfile的空文件）。

dump2dcm.exe

将ascii dump文件转换成dicom文件工具🔗

用于测试的dump文件可以拉dcmtk的源码 ：GitHub - DCMTK/dcmtk: Official DCMTK Github Mirror，然后在目录dcmwlm/data/wlistdb/OFFIS中查看，

 

这里选择wlist1.dump

对于dump文件，用记事本打开，可以看到一部分信息，其中比较重要的：

(0010,0010)（患者姓名）、(0010,0020)（患者编号）、(0010,0030)（出生日期）、(0010,0040)（性别）、(0020,000d)（检查号）、(0008,0060)（设备 Modality）、(0040,0001)（AE Title）、(0040,0002)（检查、预约日期）和 (0040,0003)（检查、预约时间）。

相关命令：

dump2dcm.exe wlist1.dump wlist1.wl --write-xfer-little

.wl 文件就是.dcm文件，但文件中并不包含真实的像素信息，只包含头部信息。

最终可以将生成的.wl文件放到wlmscpfs所对应的AE（AE_WYJ）目录下去。

findscu.exe

dicom查询SCU工具🔗

通过findscu.exe查询文件需要对应的模板文件，查出来的wl信息会根据模板信息展示，所以前提需要准备一个模板的wl文件。

在dcmtk源码文件夹dcmwlm/data/wlistqry目录下，找到对应的模板dump文件，

 

这里选择wlistqry1.dump

相关命令：

# 将wlistqry1.dump转换为将wlistqry1.wl
dcmp2dcm.exe 将wlistqry0.dump 将wlistqry0.wl --write-xfer-little
# 通过findscu查询wl
findscu.exe 10.150.2.78 104 -aec AE_WYJ wlistqry1.wl
-aec 被请求或者说被呼叫的应用端的名称，即命名的AE文件夹AE_WYJ
AE_WYJ 查询的AE
wlistqry1.wl 模板文件wl

 

storescu.exe

dicom存储SCU（c-store）工具🔗

storescu.exe -aec DCM4CHEE 10.150.1.98 11112 -v  1.dcm
-aec 即pacs的AE DCM4CHEE

dcmdump.exe

转储 DICOM 文件和数据集，可以查看.dcm等文件🔗

相关命令：

dcmdump.exe 1.dcm

worklist服务搭建

debain环境下，dcmtk的使用

1. 安装dcmtk

   apt install dcmtk

2. 准备测试数据

   数据文件wlist1.dump、查询文件wlistqry1.dump

3. dump转换成wl（本地执行）

   dcmp2dcm.exe wlist1.dump wlist1.wl --write-xfer-little
   dcmp2dcm.exe wlistqry1.dump wlistqry1.wl --write-xfer-little

4. 服务器目录结构

   /home/dicom --主文件夹
   /home/dicom/wlistdb -- worklist数据文件夹，存放所有AE文件夹
   /home/dicom/wlistdb/AE_WYJ  -- 此处新建一个AE_WYJ文件夹，表示有一个名为AE_WYJ的AE，里面存放所有对应的wl文件
   /home/dicom/wlistdb/AE_WYJ/lockfile -- 每个目录下需要存放一个空的lockfile文件，touch lockfile命令创建
   /home/dicom/wlistdb/AE_WYJ/wlist1.wl -- 将步骤3中的wlist1.wl放到此目录

5. 启动worklist服务

   # 启动端口为104的worklist服务 
   wlmscpfs -d -dfr -dfp wlistdb 104 

   后台运行可以用nohup启动

   nohup wlmscpfs -d -dfr -dfp wlistdb 104 &

   关闭直接杀掉进程

   ps -ef|grep wlmscpfs
   kill -9 进程号

pacs服务搭建

采用docker搭建的方式，确保环境下已经安装了docker，debain环境安装docker方式参见官网：Install Docker Engine on Debian | Docker Documentation

docker pacs的搭建方式主要参考了官网https://github.com/dcm4che/dcm4chee-arc-light/wiki/Run-minimum-set-of-archive-services-on-a-single-host，此处安装最新版本的dcm4chee-arc-light 5.25.0，记录关键步骤：

1. 创建一个docker的默认桥接

   docker network create dcm4chee_network

2. 开启openldap 服务

   docker run --network=dcm4chee_network --name ldap \
              -p 389:389 \
              -v /var/local/dcm4chee-arc/ldap:/var/lib/openldap/openldap-data \
              -v /var/local/dcm4chee-arc/slapd.d:/etc/openldap/slapd.d \
              -d dcm4che/slapd-dcm4chee:2.6.0-25.0

3. 开启PostgreSQL服务

   docker run --network=dcm4chee_network --name db \
              -p 5432:5432 \
              -e POSTGRES_DB=pacsdb \
              -e POSTGRES_USER=pacs \
              -e POSTGRES_PASSWORD=pacs \
              -v /etc/localtime:/etc/localtime:ro \
              -v /etc/timezone:/etc/timezone:ro \
              -v /var/local/dcm4chee-arc/db:/var/lib/postgresql/data \
              -d dcm4che/postgres-dcm4chee:14.1-25

4. 用已部署的 dcm4che Archive 5 应用程序启动 Wildfly

   docker run --network=dcm4chee_network --name arc \
              -p 8080:8080 \
              -p 8443:8443 \
              -p 9990:9990 \
              -p 9993:9993 \
              -p 11112:11112 \
              -p 2762:2762 \
              -p 2575:2575 \
              -p 12575:12575 \
              -e POSTGRES_DB=pacsdb \
              -e POSTGRES_USER=pacs \
              -e POSTGRES_PASSWORD=pacs \
              -e WILDFLY_WAIT_FOR="ldap:389 db:5432" \
              -v /etc/localtime:/etc/localtime:ro \
              -v /etc/timezone:/etc/timezone:ro \
              -v /var/local/dcm4chee-arc/wildfly:/opt/wildfly/standalone \
              -d dcm4che/dcm4chee-arc-psql:5.25.0

   相关命令执行完毕后，直接打开网页：

   http://10.150.2.78:8080/dcm4chee-arc/ui2/

   如果可以成功打开，则说明已经安装成功了。

   

5.  使用本地storescu.exe进行测试

   storescu.exe -aec DCM4CHEE 10.150.1.98 11112 -v 1.dcm

   

    可以确定已经上传成功，上传成功的dcm可以在series下点击submit查看