使用Stratasys创建3D打印医学模型的工作流程

数十年来，在医学界，外科医生及其专业支持团队在执行术前计划方法时一直依靠X射线，计算机断层扫描（CT）扫描和磁共振成像（MRI）数据。这些诊断工具实际上是救生员，但是这些图像的分辨率和2D透视图使确定解剖学几何结构的全部细节变得困难。当观看平板电影和数字显示器时，细微，严重的异常或隐藏的几何形状可能不会被注意到。

凤凰儿童医院生产的3D打印心脏模型。（图片由凤凰城儿童医院提供）

随着3D打印的出现，许多外科医生现在都将3D模型用于手术计划和患者交流。尽管成本是主要的阻碍因素，但此类模型的使用率有所上升。此外，正在努力量化减少手术室时间/费用和改善患者预后的益处；请参阅Medical 3D Printing Registry（ACR / RSNA）。支持这一概念的高分辨率，多材料PolyJet的三维打印机从Stratasys公司。

但是，患者的CT和MRI数据如何变成您可以握在手中的独特3D打印模型？您如何针对特定的分析或手术模型细分感兴趣的领域？这篇博客文章描述了工作流程中的必要步骤，通常由谁执行，以及为改进流程的每个步骤所面临的挑战。

患者解剖结构的数据采集

几十年来，当我们想到成像时，就会想到X射线技术。但是，胶片上的经典单2D图像不能用于驱动3D模型，因为它们是定性的而不是定量的。起作用的主要选项包括一系列X射线，称为CT扫描，MRI数据，并在较小程度上包括计算机断层扫描血管造影（CTA）和磁共振血管造影（MRA）。每种方法各有利弊，因此必须与正确的解剖结构和最终用途相匹配。

CT扫描包括一系列X射线，这些X射线在特定的身体部位上横向均匀分布，通常生成数百个图像文件。这些可以快速获取并提供高分辨率，但是，它们不能很好地显示不同类型的软组织，并且该过程依赖于长时间暴露于辐射源。

采样执行CT扫描时生成的多个数字图像（图像由nymphoenix / Shutterstock.com提供。）

典型的CT分辨率在X和Y方向上为500微米，在Z方向上为1mm。这可由Stratasys打印机轻松处理。例如，J750数字解剖打印机的打印分辨率为X轴为42微米，Y轴为84微米，Z轴为14到27微米，这不仅可以捕获所有可能的扫描特征。

计算机断层扫描血管造影（CTA）涉及相同的设备，但使用造影剂。通过这种方法，较亮的区域会突出显示血液流动的区域。此过程在显示血管方面是优越的，但不能很好地区分组织或骨骼。

MRI数据基于不同的技术，其中强磁场与体内的水相互作用。这种方法可区分软组织并显示小血管，但价格昂贵且不能有效捕获骨头。类似地，磁共振血管造影（MRA）使用的造影剂可以跟踪小血管，这对于识别中风很重要，但无法记录组织。MRI扫描可能还包括分散注意力的伪影，并提供较差的区域对比度。

数字成像数据的最终来源是正电子发射断层扫描（PET）。在此，放射性物质附着在癌症等生物活性区域上。通过传感器获得的数据很有用，但非常局限性-它不会显示周围的组织。

细分：从DICOM到STL格式的转换

无论是通过CT还是MRI设备生成的，解剖图像数据都按照医学数字成像和通信（DICOM）标准存储在数字文件中。该标准的两个方面与3D打印医学模型有关：DICOM文件包括针对患者的受HIPPA保护的信息，并且必须将单个图像中的数据合并并转换为实体模型，并定义和划分感兴趣的区域。

提供了各种软件包和服务，可将DICOM数据转换为STL模型文件（用于3D打印机输入的标准格式），同时去除个人识别信息。（后者必须遵守HIPPA法规：切勿直接将DICOM文件发送到任何服务局。）

分割涉及将数字图像划分为不同的像素集，将区域定义为器官，骨骼，血管，肿瘤等，然后将这些子区域分组并组合为保存为STL文件的3D模型。这种格式不仅比一堆单独的图像提供更有意义的信息，而且可以将其导出以进行3D打印。

已处理CT扫描的示例，已合并为多视图3D可视化并另存为STL文件。（图片由PADT Inc.提供）

用于识别和分割3D CT扫描组合序列中不同区域的标准度量单位是Hounsfield单位。这是无量纲的值，定义为组织密度/ x射线吸收率；作为参考，水=零，肾脏= + 40，骨骼= +1000。

需要人工指导来设置阈值霍恩斯菲尔德水位，并画出感兴趣区域的周长。您可以定义具有相同阈值水平的组，切出不需要的某些区域（例如，“遮盖”肺以专注于脊椎），并使用常见模型类型存在的预设值。通常，放射科医生或受过训练的生物医学工程师执行此任务，因为正确识别边界是一项不重要的判断任务。

一项特别具有挑战性的任务是打印血管的工作流程，而不是骨骼或器官。CTA / MRA成像的输出是血池，而不是封闭的血管。在这种情况下，用户需要第三方软件在血池形状周围创建X厚度的外壳，然后保留两个模型文件（池和血管）以指导打印血管壁及其内部支撑结构（在Stratasys上） J750数字解剖打印机，可溶解并溶解。）

到目前为止，仅存在一些医疗细分软件包：

• Materialize Mimics Innovation Suite因其出色的图像分析功能而享誉国际，可让您编写脚本化例程以自动执行分割任务的重复方面。还有一些工具可用于解释带有金属假象的图像，设计零件之间的支撑连接，测量指定的特征以及渲染所得3D模型的视图。

• Synopsys Simpleware ScanIP是3D图像分割，处理和网格划分平台，可处理MRI，CT和非医学成像系统中的数据。Simpleware ScanIP可以消除或减少灰度图像中的有害噪声，可以裁剪到感兴趣的区域，支持自动和用户指导的分割和测量，并包括API脚本。模块可用于Cardio，Ortho和Custom解决方案。

• Invesalius 3是开源软件，可以重建CT和MRI数据，以手动和半自动模式生成3D可视化，图像分割和图像测量。

• Embodi3D / Democratiz3D是一项在线服务，可让您上传一系列CT扫描，选择基本解剖类型（骨骼，详细的骨骼，牙齿，肌肉等），选择免费的中低分辨率或付费高分辨率转换服务，并接收指向自动生成的STL文件的链接。（用户无需与文件进行交互即可选择任何遮罩，测量或裁剪。）该网站还提供可下载的3D可打印模型和3D打印服务。

请注意，对于如何使用其处理结果，这些包装可能或没有510K FDA许可。用户必须联系供应商以了解当前状态。

设置STL文件进行打印

大多数细分软件包为您提供了最终模型的选定分辨率的选项。与所有STL文件一样，三角形的数量越多，所显示的细节越精细，但是对于在打印机软件中进行合理设置而言，模型尺寸可能太大。您可能还会发现，您仍想编辑模型，进行一些孔修复或平滑处理，切下一个部分以暴露内部视图，或者为脆弱和/或较重的解剖部分添加机械支撑/支撑。Materialize Magics软件可以轻松完成所有这些操作，否则，添加一个可以编辑STL文件或在STL文件上创建/合并几何图形的包将很有用。

适用于典型Stratasys 3D打印模型的从CT扫描到打印的医学建模软件工作流程。

设置文件进行打印的人都需要根据经验做出许多决定。对于Stratasys Connex3，J55，J8系列或J750数字解剖打印机，该过程首先将文件放入GrabCAD Print中并确定优化的构建方向。接下来，分配颜色和材料，包括透明部分，透明颜色的百分比以及柔性/可变硬度计材料，它们可以用于单个零件或多实体模型。

特别是对于J750数字解剖打印机，用户可以将肌肉骨骼，心脏，血管和一般解剖结构分配给每个模型，然后选择详细的预先指定的材料和属性来打印其触觉响应模仿实际生物力学行为的模型，例如“骨质疏松症”。骨。” （请参见边栏）。

我测试了Embodi3D提供的免费在线Democratiz3D细分服务。按照他们的教程，我能够将自己的267个CT图像的DICOM文件文件夹转换为没有患者ID信息的文件，从而生成一个STL输出文件。我选择了“骨骼/详细/中等分辨率”选项，该选项忽略了所有其他可见的解剖结构，然后将生成的模型带入免费软件Meshmixer中以编辑（裁剪）STL。这使我可以将下脊柱模型的三个椎骨部分归零，然后将其保存为3MF格式。

最后，我在GrabCAD Print中打开了新的3MF文件，该文件是多功能的Stratasys打印机设置软件，可与FDM（细丝）和PolyJet（紫外线固化树脂）打印机一起使用。对于前一种情况，我在F370 FDM打印机上的象牙ASA中打印了模型，对于后一种情况，我可以分配一种乳白色的颜色（Red248 / Green248 / Blue232）以呈现骨骼状外观，J55 PolyJet办公环境打印机上的模型。

3MF椎骨模型的GradCAD Print软件设置，可以在Stratasys J55 PolyJet全彩色3D打印机上以用户定义的骨骼颜色进行打印。（图片由PADT Inc.提供）

通过CT扫描创建的3D打印椎骨零件：左侧是Stratasys F370 FDM打印机的ABS零件；右边是Stratasys J55 PolyJet打印机的Vero刚性树脂材料。（图片由PADT Inc.提供）  

经验有助于准确地分割零件，但是更多功能（例如启用AI的选择）和更多在线教程正帮助扩大熟练的图像处理卫生专业人员的领域。克拉克森学院（内布拉斯加州奥马哈市）最近还宣布了首个医学3D打印专家证书计划。

与PADT接触，以了解有关医学建模和Stratasys 3D打印机的更多信息。

PADT Inc.是数值模拟，产品开发以及3D打印产品和服务的全球认可提供商。有关Stratasys打印机和材料的更多信息，请通过info@padtinc.com与我们联系。

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侧边栏：J750数字解剖打印机

该Stratasys公司J750数码解剖打印机使用的PolyJet树脂3D打印技术打造的部件模仿外观和人体组织，器官和骨骼的生物力学响应。用户可以从一系列预编程的解剖结构中进行选择，然后自动生成材料成分以及准确的内部结构。柔软的心脏区域允许进行切割，缝合和修补操作，而空心血管模型则支持使用导丝和导管进行训练。一般的解剖模型可以复制包囊的和非包囊的肿瘤，同时可以创建骨质疏松和/或包括支持敲击，扩孔和螺钉插入的区域的骨骼结构。

当前，数字解剖打印机的型号范围为80到110霍恩斯菲尔德单位。高价值的材料正在开发中，这将有助于医院创建用于校准其CT系统的模型。

当前可用的数字解剖打印机型号/部分分配：

结构性心脏：

• 凝块
• 帧
• 心肌层
• 加强
• 实体瘤
• 瓣环
• 瓣科
• 瓣膜小叶
• 瓣膜钙化
• 容器壁

大体解剖：

• 致密结缔组织
• 空心器官
• 坚实的内部器官
• 实体瘤

血管：

• 凝块
• 治具
• 帧
• 凝胶支持
• 进水口
• 钢筋
• 实体瘤
• 瓣环
• 瓣膜小叶
• 血管钙化
• 容器壁

肌肉骨骼

• 小关节
• 普通骨
• 椎间盘
• 韧带
• 长骨
• 神经
• 开放端
• 肋骨
• 头骨
• 椎骨