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原创 Python seaborn可用来干什么,看作者怎么说?
seaborn 的一个关键功能是数据集中变量可以自动“映射”到图形的视觉属性上,即指将数据集中的变量与图形的视觉属性(如颜色、大小、样式)相关联,如下图,hue="客人性别"表示数据集tips中的“客人性别”变量映射到散点图的颜色属性,Female和Male表示不同的颜色,style="是否吸烟"表示数据集tips中的“是否吸烟”变量映射到散点图的marker属性,No和Yes表示不同的形状,seaborn函数的默认参数即可输出高质量统计图,同时也提供大量个性化参数,例如,),文章使用seaborn配图,
2024-09-26 12:08:00 817
原创 seaborn、sklearn强力扩展--seaborn_analyzer
本次分享Python seaborn、sklearn的强力扩展-seaborn_analyzer。seaborn_analyzer对seaborn、sklearn的部分功能进行封装,是一个不错的数据分析和可视化工具。以下简单介绍seaborn_analyzer功能,是seaborn矩阵图的扩展,用于制作同时包含散点图和相关系数矩阵的成对图,
2024-08-09 12:50:02 517
原创 gff格式转gff3
gt-bed_to_gff3gt bed_to_gff3 test.bed >test.gff3输入test.bed输出test.gff3
2024-08-07 11:26:12 97
原创 不写代码,这样使用Python seaborn、matplotlib
今天分享一个PyQt5 GUI工具i,动动鼠标拖拽就使用Python的Matplotlib、Seaborn进行绘图,并导出高清PDF。
2024-08-07 11:20:04 378
原创 在excel中优雅使用Python
本次分享一个python excel工具pyxll,可在Excel中使用Python的主流可视化工具,如Seaborn等。pyxll结合seaborn定义一个sns_plot函数,重启下Excel,出现如下Jupyter按钮,excel中使用sns_plot函数,Excel中使用seaborn。
2024-08-06 12:35:20 430
原创 Python seaborn美化篇-风格style
本文分享Python seaborn中通过风格style美化图形。风格(style),用于设置the general style of the plots,例如,图中网格线是否开启、颜色、线宽等。
2024-07-30 09:15:38 217
原创 module AttributeError: ‘matplotlib.cm has no attribute ‘register_cmap‘
这个一般是matplotlib版本变化导致 'register_cmap‘函数名称发生了改变,升高或者降低matplotlib版本版本即可。
2024-07-29 13:00:34 544
原创 bcftools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file:
bcftools版本太低。
2024-07-28 15:34:12 79
原创 [E::bcf_hdr_parse] Could not parse the header, sample line not found
[E::bcf_hdr_parse] Could not parse the header, sample line not found
2024-07-28 15:32:10 44
原创 Python seaborn超级细节篇-使用配色palette
本文分享Python seaborn中通过配色palette美化图形。配色(palette),用于设置color palette,例如,Set1、#a1c9f4、red等。内容很多,快速浏览一下,节选自👉这里展示部分,
2024-07-26 12:41:59 1612
原创 Py seaborn美化篇-比例尺度context
本文分享Python seaborn中通过比例尺度context美化图形。比例尺度(context),设置the scaling of plot elements,例如,图中文字大小、标记marker大小、线条宽度等。不理解,没关系,下面依次举例详细介绍。
2024-07-25 23:15:04 333
原创 vcf.gz file, but bcftools says it‘s not compressed with bgzip
报错:解决方法1解决方法2。
2024-07-25 22:22:33 52
原创 Tableau很贵,试试Jupyter Notebook这个插件!
本次分享一个Python数据分析工具:PyGWalker。PyGWalker缩写来自“Python binding of Graphic Walker”,它将Jupyter Notebook与Graphic Walker集成,Graphic Walker是Tableau的一种开源替代品,在一些场景PyGWalker可实现Tableau功能,关键还免费。
2024-07-03 21:42:33 210
原创 一图胜千言|用Python搞定统计结果展示!
分享一份原创Python可视化教程:530张图形+8000行代码,轻松搞定统计结果展示,部分如下,每类图表包含详细代码+详细代码注释,多达8000行代码,例如,
2024-07-03 21:40:10 699
原创 用可视化的方式学统计学
本次分享一个统计学学习工具:看见统计。看见统计致力于用数据可视化 (使用D3.js完成) 让统计概念更容易理解,源于布朗大学几位作者👇看见统计共有6个章节,下面来看看具体内容,对于一个(性质比较好的)分布,如果我们有足够大的独立同分布的样本,其样本均值会(近似地)呈正态分布,样本数量越大,其分布与正态越接近。动态模拟贝叶斯计算概率所需要的样本信息,拖动图中的数据点,观察它们对回归直线的影响,选择一个t概率分布来生成样本,构造置信区间,
2024-07-02 12:39:39 84
原创 当Matplotlib遇见SciencePlots
分享一个Matplotlib扩展工具SciencePlots,一行代码绘制science、nature、ieee等要求的图形。
2024-07-02 11:41:27 505
原创 53个图表,完美展示数据组合关系!
本文介绍使用Python工具seaborn详细实现(Multi-plot grids)表,包含组合关系图是一种图形化工具,用于在单个图表中展示多种图形,以便从不同维度深入挖掘数据。可以进一步分为:散点图矩阵(scatterplot matrix)、个性化散点图矩阵(flexible scatterplot matrix)、边际图(joint grids)和个性化边际图(flexible joint grids)等组合关系图。节选自👉12.3万字+500多张图形+8000行代码......
2024-07-01 23:11:46 454
原创 141个图表,完美展示数据分类别关系!
本文介绍使用Python工具seaborn详细实现分类关系图表,包含8类图141个代码模版。分类关系图表用于展示数字变量和一个或多个分类变量之间的关系,可以进一步分为:箱形图(box plot)、增强箱形图(enhanced box plot)、小提琴图(violin plot)、抖动散点图(jitter plot)、蜂群图(beeswarm plot)、点图(point plot)、柱状图(bar plot)、分类柱状图(count plot )。
2024-07-01 12:54:01 1215
原创 51个图表,完美展示数据分布关系!
本节介绍seaborn展示数据分布关系的图表(Distribution plots)的实现,该类图表用于展示数据集的分布规律,帮助快速获取数据多方面信息,例如,观测值的范围、中心趋势、是否存在某个方向上严重偏斜、是否存在双峰性、是否存在显著的异常值等等。分布关系的图表包含:直方图、核密度估计(KDE)图、累积曲线图和轴须图(rug plot)。
2024-06-30 16:58:17 400
原创 新工具:轻松可视化基因组,部分功能超IGV~
figeno擅长可视化三代long reads、跨区域基因组断点视图(multi-regions across genomic breakpoints)、表观组数据(HiC、ATAC-seq和ChIP-seq等)可视化、WGS中的CNV和SV可视化等。支持三代测序数据可视化(Nanopore, PacBio数据),例如, base modification(5mC、hmC、6 mA、5mC、5hmC))HiC data across breakpoints,展示跨基因组区域的染色质相互作用,
2024-06-30 16:56:15 357
空空如也
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