Omics精进02|临床Gene Panel设计

最新推荐文章于 2025-04-05 23:35:25 发布
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分类专栏： # 生物信息 文章标签： 生物学 生物信息学
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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_21478261/article/details/110312789
版权
本文介绍了泛癌Panel设计过程，包括关键参数如检测基因数目、变异类型、免疫治疗相关生物标志物等。以Roche FoundationOne CDx为例，讨论了国内外泛癌与小Panel产品的差异，并强调了临床应用中用药信息的重要性。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

  • 本文以泛癌Panel设计为例，简单介绍panel的设计过程，泛癌即不分癌种（无论患者是肺癌、肝癌还是乳腺癌等，该panel均可实用。）
  • 个人知识有限，欢迎指点不足。

 

目录

国外泛癌Panel产品

国内癌种小Panel产品

Panel长啥样

Panel关键参数

Panel设计

reference

国外泛癌Panel产品

获FDA批准

目前仅有以下三个泛癌panel获得FDA批准，没错，都是国外的。

  • Roche FoundationOne CDx 324基因（2017年获批）
  • MSK MSK-IMPACT 468基因（2017年获批）
  • NantHealth Omics Core 19,396基因（基于WES，包含MSK-IMPACT 468基因，严格讲不算panel。2019年获批）

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《机器学习》周志华课后习题答案——第一章（1-3题完结）
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周志华《机器学习》总结——四、决策树
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机器学习是一种人工智能（AI）的子领域，致力于研究如何利用数据和算法让计算机系统具备学习能力，从而能够自动地完成特定任务或者改进自身性能。机器学习的核心思想是让计算机系统通过学习数据中的模式和规律来实现目标，而不需要显式地编程。 机器学习应用非常广泛，包括但不限于以下领域： 图像识别和计算机视觉： 机器学习在图像识别、目标检测、人脸识别、图像分割等方面有着广泛的应用。例如，通过深度学习技术，可以训练神经网络来识别图像中的对象、人脸或者场景，用于智能监控、自动驾驶、医学影像分析等领域。 自然语言处理： 机器学习在自然语言处理领域有着重要的应用，包括文本分类、情感分析、机器翻译、语音识别等。例如，通过深度学习模型，可以训练神经网络来理解和生成自然语言，用于智能客服、智能助手、机器翻译等场景。 推荐系统： 推荐系统利用机器学习算法分析用户的行为和偏好，为用户推荐个性化的产品或服务。例如，电商网站可以利用机器学习算法分析用户的购买历史和浏览行为，向用户推荐感兴趣的商品。 预测和预测分析： 机器学习可以用于预测未来事件的发生概率或者趋势。例如，金融领域可以利用机器学习算法进行股票价格预测、信用评分、欺诈检测等。 医疗诊断和生物信息学： 机器学习在医疗诊断、药物研发、基因组学等领域有着重要的应用。例如，可以利用机器学习算法分析医学影像数据进行疾病诊断，或者利用机器学习算法分析基因数据进行疾病风险预测。 智能交通和物联网： 机器学习可以应用于智能交通系统、智能城市管理和物联网等领域。例如，可以利用机器学习算法分析交通数据优化交通流量，或者利用机器学习算法分析传感器数据监测设备状态。 以上仅是机器学习应用的一部分，随着机器学习技术的不断发展和应用场景的不断拓展，机器学习在各个领域都有着重要的应用价值，并且正在改变我们的生活和工作方式。
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机器学习是一门多领域交叉学科，涉及概率论、统计学、逼近论、凸分析、算法复杂度理论等多门学科。它专门研究计算机怎样模拟或实现人类的学习行为，以获取新的知识或技能，重新组织已有的知识结构使之不断改善自身的性能。机器学习是人工智能的核心，是使计算机具有智能的根本途径。 随着统计学的发展，统计学习在机器学习中占据了重要地位，支持向量机（SVM）、决策树和随机森林等算法的提出和发展，使得机器学习能够更好地处理分类、回归和聚类等任务。进入21世纪，深度学习成为机器学习领域的重要突破，采用多层神经网络模型，通过大量数据和强大的计算能力来训练模型，在计算机视觉、自然语言处理和语音识别等领域取得了显著的成果。 机器学习算法在各个领域都有广泛的应用，包括医疗保健、金融、零售和电子商务、智能交通、生产制造等。例如，在医疗领域，机器学习技术可以帮助医生识别医疗影像，辅助诊断疾病，预测病情发展趋势，并为患者提供个性化的治疗方案。在金融领域，机器学习模型可以分析金融数据，识别潜在风险，预测股票市场的走势等。 未来，随着传感器技术和计算能力的提升，机器学习将在自动驾驶、智能家居等领域发挥更大的作用。同时，随着物联网技术的普及，机器学习将助力智能家居设备实现更加智能化和个性化的功能。在工业制造领域，机器学习也将实现广泛应用，如智能制造、工艺优化和质量控制等。 总之，机器学习是一门具有广阔应用前景和深远影响的学科，它将持续推动人工智能技术的发展，为人类社会的进步做出重要贡献。
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原题：在西瓜数据集上实现K近邻分类器。 #!/usr/bin/python # -*- coding:utf-8 -*- import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.ensemble import BaggingClassifier from sklearn.tree import Decisi...
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机器学习 习题答案 2.6 完成变型空间表示定理的证明（定理2.1） 定理2.1：变型空间表示定理 领X为一任意的实例集合，H为X上定义的布尔假设的集合。令c：X{0,1}为X上定义的任一目标概念，并令D为任一训练样例的集合{}。对所有的X，H，c，D以及良好定义的S和G： 证明：对VSH，D中任一h： ①当h∈S时，取s＝h，则有h≥gs成立 ②当hS时，即 (h1H）[(h>gh1)∧Consistent(h1,D)] 若h1S，显然h≥gs成立；
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文章目录 第一章绪论 1. 表1.1中若只包含编号为1和4的两个样例，是给出相应的版本空间。 2. 与使用单个合取式来进行假设表示相比，使用“析合范式”将使得假设空间具有更强的表示能力，例如 3. 若数据包含噪声，则假设空间中有可能不存在与所有训练样本都一致的假设。在此情形下，试设计一种归纳偏好用于假设选择。 4. 本章在1.4节在论述“没有免费的午餐”定理时，默认使用了“分类错误率”作为性能度量来对分类器进行评估。若换用其他性能度量\ellℓ,则式(1.1)将改为下式，试证明NLF仍然成立。 5. 试述机
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第一章 绪论 思维导图 关键问题 1.假设空间 概念 所有属性可能取值构成的假设集合 计算 列出可能的样本点，即特征向量 2.版本空间 概念 与训练集一致的假设集合 习题: 1.1 计算步骤 先列出假设空间 删除与正例不一致，与反例一致的假设 得到版本空间 第一步 假设空间： 色泽取值：青绿、乌黑 根蒂取值：蜷缩、稍蜷 敲声取值： 浊响、沉闷 1. 色泽 = *, 根蒂 = *, 敲声 = * 2. 色泽 = 青绿, 根蒂 = *, 敲声 = * 3. 色泽 = 乌黑, 根蒂 = *, 敲
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周志华机器学习全部课程
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周志华教授的机器学习课程包括以下内容： 1. 机器学习基础：概率论，统计学，线性代数等数学基础知识； 2. 监督学习：K近邻，决策树，朴素贝叶斯，感知机，支持向量机，神经网络等算法； 3. 无监督学习：聚类，降维，概率密度估计等算法； 4. 半监督学习：半监督聚类，半监督分类等算法； 5. 强化学习：马尔可夫决策过程，值迭代，策略迭代等算法； 6. 深度学习：深度神经网络，卷积神经网络，循环神经网络等算法。 以上是周志华教授机器学习课程的主要内容，该课程在学术界和工业界都有很高的声誉。
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