FAILED. This error must be resolved in order to build HTSlib successfully.

最新推荐文章于 2023-04-01 22:36:44 发布
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分类专栏： # 生物信息 文章标签： linux 运维 服务器
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samtools依赖HTSlib，无root安装HTSlib往往报下面错误

checking for zlib.h... no
checking for inflate in -lz... no
configure: error: zlib development files not found

HTSlib uses compression routines from the zlib library http://zlib.net.
Building HTSlib requires zlib development files to be installed on the build
machine; you may need to ensure a package such as zlib1g-dev (on Debian or
Ubuntu Linux) or zlib-devel (on RPM-based Linux distributions or Cygwin)
is installed.


FAILED. This error must be resolved in order to build HTSlib successfully.

HTSlib安装需要很多系统依赖，上面的问题是出在系统没有安装zlib，这类安装往往需要root权限，比如yum install zlib-devel等。

如果没有root权限，可以conda解决：

#创建一个干净的htslib
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qq_21478261
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