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Centos7.7重装yum和python
版本Cnetos7.7 重装python和yum使用yum时发现没有这个模块按照网上教程 查看whereis python 看一看都有哪些python,发现我没有了centos自带python2.6,这也就是说不能通过修改vi /user/bin/yum修改成python2.6来拯救我的yum。于是准备重装python和yum看网上大部在http://mirrors.163.com/centos/7/os/x86_64/Packages/下载文件,但我发现对应的7.7版已经已经不存在,所以我到了官网原创 2021-01-19 10:13:26 · 516 阅读 · 1 评论 -
sudo pip3/pip:未找到命令...
原因是pip3命令不是命令链接解决办法: sudo ln -s /usr/local/bin/pip3 /usr/bin/pip3原创 2019-10-30 10:32:35 · 5970 阅读 · 3 评论 -
一次性解决:TypeError: initialize() got an unexpected keyword argument 'make_current'
一次性解决:TypeError: initialize() got an unexpected keyword argument 'make_current'原创 2019-10-09 19:29:37 · 1676 阅读 · 0 评论 -
python机器学习基础(二)
接上一篇:python机器学习基础教程(一)一,构建第一个模型:K近邻算法scikit-learn中有很多可用的分类算法。这里我们用的是K近邻分类器,这是一个很容易理解的算法。核心思想是:要对一个新的数据点作出预测,算法会在训练集中寻找与这个新数据点距离最近的数据点,然后将找到的数据点的标签赋值给这个新数据点。原创 2019-10-03 15:34:17 · 222 阅读 · 0 评论 -
解决python2 ImportError: cannot import name compat
导入pandas包时出现ImportError: cannot import name compat 问题降级pandas解决问题。原创 2019-09-29 09:14:50 · 5810 阅读 · 2 评论 -
python机器学习基础(一)
第一个应用:鸢尾花分类本文构建第一个机器学习模型,并介绍一些核心概念和术语。原创 2019-09-28 22:48:35 · 356 阅读 · 0 评论 -
python 实现otu表水平转化
import xlrdimport xlwtimport xlsxwriteri=0 j=1 p=0 k=0 numi=0 numj=0worksheet = xlrd.open_workbook(‘/media/sf_Myshared/cdi_schubert.otu_table.100.denovo.xlsx’)workbook= xlrd.open_wo...原创 2018-08-24 17:36:30 · 768 阅读 · 0 评论 -
jupyter notebook中加入python3
jupyter notebook中只有python2没有python3怎么办?要想加入jupyter notebook必须you内核 !!!查看jupyter notebook kernel:jupyter kernelspec list删除notebook kernel:jupyter kernelspec remove kernelname确保python3环境下安装了ip...原创 2019-09-27 11:47:14 · 5366 阅读 · 6 评论 -
python实现fastq文件GC含量的计算
python实现fastq文件GC含量的计算fastq格式是生物信息分析中最常见的格式之一通常我们可以将测序的数据分为双端测序和单端测序双端测序的数据含有两个fastq格式的文件,单端测序的数据只有一个fastq格式的文件第一行是用来区分不同reads的一个ID号,一般以@符号开头,这一行是用来区分不同的reads,而这一行本身包含了很多的信息。Read Record HeaderF...原创 2019-09-27 09:30:57 · 5429 阅读 · 1 评论